Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 GTF2IP22-201ENST00000554443 182 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 CFL2-206ENST00000556161 546 ntTSL 4 BASIC7.38□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 MIR3912-201ENST00000577566 105 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 MYLK-221ENST00000583087 678 ntTSL 4 BASIC7.38□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 AC068790.7-201ENST00000602347 528 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 AL390816.3-201ENST00000604527 1066 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 AL365503.1-201ENST00000605247 905 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 AL354760.1-201ENST00000608357 643 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 AL121612.2-201ENST00000612261 482 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 AC018445.2-201ENST00000622987 260 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 AC019278.1-201ENST00000623516 479 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 AC007389.5-201ENST00000629214 744 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 SMARCA2-229ENST00000634781 1106 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 SMARCA2-206ENST00000382185 1584 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 ARSD-AS1-201ENST00000414053 816 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 LINC01198-201ENST00000416521 500 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 AL158835.2-201ENST00000430970 300 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 AL627308.1-201ENST00000435693 821 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 C4orf26-202ENST00000435974 560 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 PTMAP6-201ENST00000439110 327 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 TCEA1P1-201ENST00000449716 880 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 HMGB1P5-202ENST00000451497 985 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 AC024132.2-201ENST00000506878 482 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 STMN1P2-201ENST00000508435 439 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 AC092490.3-201ENST00000545370 572 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 LINC02310-201ENST00000556762 572 ntTSL 4 BASIC7.37□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 AC009142.1-202ENST00000562565 563 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 MIR4691-201ENST00000583764 85 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 AC006557.3-201ENST00000592926 517 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 AC011374.2-201ENST00000607135 526 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 AC093799.2-201ENST00000610062 578 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 AC015922.4-201ENST00000612568 690 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC7.37□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 TEX41-254ENST00000626394 423 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 SATB1-AS1-259ENST00000629477 853 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 ALB-219ENST00000621085 1418 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 RNF212B-201ENST00000399905 1071 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 RNU6ATAC7P-201ENST00000408111 127 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 RPS15AP38-201ENST00000413110 372 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 AL359633.2-201ENST00000415787 622 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 OR5AW1P-201ENST00000426334 1006 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 AC241644.1-201ENST00000431525 446 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 PSMD10P3-201ENST00000437000 448 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 AC096644.1-201ENST00000446169 390 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 IGHV5-78-201ENST00000450948 295 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 LINC00393-202ENST00000452852 485 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 RPS20P4-201ENST00000461659 355 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 AC091180.1-201ENST00000462104 372 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 XACT-201ENST00000468762 497 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 UBTFL6-201ENST00000477929 1024 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 AC113404.3-201ENST00000506621 555 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 RN7SKP141-201ENST00000516167 338 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 RN7SKP147-201ENST00000517154 244 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 AC016074.1-201ENST00000518339 636 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 AC022874.1-201ENST00000526382 550 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 AC022196.1-202ENST00000559570 462 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 AC010551.2-201ENST00000569200 416 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 AC011447.4-201ENST00000587562 111 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
NEUROD1Q13562 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.8 ms