Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 MTND4LP14-201ENST00000429447 288 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 MRPS18BP2-201ENST00000434310 759 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AF127577.2-201ENST00000436429 824 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 LINC01891-201ENST00000439798 538 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 RNF219-AS1-202ENST00000444769 590 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AC006326.1-201ENST00000445465 787 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AC105398.1-201ENST00000446073 402 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 RPL23AP43-201ENST00000446445 471 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 CYCSP42-201ENST00000450823 238 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 RANP1-206ENST00000455094 651 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AC090142.1-201ENST00000465776 462 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AC099509.1-201ENST00000502437 652 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 TMPRSS11BNL-205ENST00000514295 1262 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AC116917.1-201ENST00000520558 305 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 MORF4L1P3-201ENST00000525966 950 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AP000755.1-201ENST00000527100 507 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 OR4A45P-201ENST00000529954 901 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AC093014.1-201ENST00000548926 724 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AC068643.2-202ENST00000552759 622 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 LINC02303-202ENST00000554711 531 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AL049839.1-201ENST00000556151 657 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AC025918.2-201ENST00000558683 763 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AC067805.1-201ENST00000559344 470 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AC090415.2-201ENST00000584078 374 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 Z98949.1-203ENST00000597284 851 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AC011492.1-201ENST00000600023 315 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AC092474.3-201ENST00000603022 568 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AC095055.1-201ENST00000603472 1113 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AC105254.2-201ENST00000603636 436 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AC098935.2-201ENST00000604222 466 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AL160290.3-201ENST00000604869 165 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AL365503.1-201ENST00000605247 905 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AL355512.1-201ENST00000609514 488 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AL034549.1-201ENST00000615120 578 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AC090116.1-201ENST00000615679 446 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 SYNJ2BP-COX16-205ENST00000621525 929 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 FO681491.1-202ENST00000623392 737 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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VAMP3Q15836 TEX41-279ENST00000629149 609 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AL136084.2-203ENST00000630758 690 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 SAMSN1-202ENST00000400564 1382 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
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VAMP3Q15836 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
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VAMP3Q15836 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 GNAT3-201ENST00000398291 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
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VAMP3Q15836 AC064874.1-202ENST00000440101 287 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
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VAMP3Q15836 LINC01364-201ENST00000452509 889 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AL021940.1-201ENST00000454271 677 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
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VAMP3Q15836 OR9M1P-201ENST00000459641 921 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 RN7SL319P-201ENST00000480656 221 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 RPL7P39-201ENST00000481157 744 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 GAPDHP39-201ENST00000481866 979 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AC004069.2-201ENST00000505438 1114 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 IGKV2-38-201ENST00000517443 247 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 RAD21-203ENST00000517749 1003 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 OR7E128P-201ENST00000532736 1024 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AL671883.2-201ENST00000539514 536 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AC006512.2-201ENST00000543250 486 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
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VAMP3Q15836 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 LINS1-207ENST00000560133 1196 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AC016180.1-201ENST00000567945 403 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AC010547.6-201ENST00000571789 193 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AC092354.2-201ENST00000607786 514 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 CLPS-202ENST00000616014 436 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
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