Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SS18Q15532 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AC119674.1-212ENST00000641155 993 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SS18Q15532 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
SS18Q15532 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
SS18Q15532 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
SS18Q15532 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
SS18Q15532 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
SS18Q15532 CASC19-261ENST00000641853 1638 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SS18Q15532 API5-210ENST00000534600 1760 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SS18Q15532 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
SS18Q15532 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
SS18Q15532 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SS18Q15532 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SS18Q15532 MTRNR2L6-201ENST00000604952 1447 ntAPPRIS P1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SS18Q15532 RNU4-39P-201ENST00000362455 127 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SS18Q15532 UBE2U-201ENST00000371076 1136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
SS18Q15532 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SS18Q15532 TRGV11-201ENST00000390340 463 ntAPPRIS P1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SS18Q15532 U3.22-201ENST00000391120 215 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SS18Q15532 ATP5F1P4-201ENST00000397288 746 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SS18Q15532 GSTA12P-201ENST00000402398 508 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SS18Q15532 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SS18Q15532 LSM5-206ENST00000409987 504 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SS18Q15532 RN7SKP33-201ENST00000410942 340 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AC003092.2-201ENST00000411946 446 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SS18Q15532 LINC02089-201ENST00000412360 682 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SS18Q15532 PRELID3BP11-201ENST00000414230 479 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AIMP1P1-201ENST00000418670 937 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AC114814.2-201ENST00000419195 485 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SS18Q15532 COX6CP17-201ENST00000421389 185 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AL136979.1-201ENST00000421645 1120 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SS18Q15532 COX6CP15-201ENST00000426313 211 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SS18Q15532 HIGD1AP12-201ENST00000427832 281 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AL583785.1-201ENST00000428006 512 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SS18Q15532 EIF2S2P3-201ENST00000428356 999 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SS18Q15532 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SS18Q15532 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SS18Q15532 TXNP1-201ENST00000441872 371 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SS18Q15532 RAD1P2-201ENST00000446414 663 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SS18Q15532 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SS18Q15532 TAF8-207ENST00000482432 556 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SS18Q15532 CFAP44-AS1-202ENST00000498480 686 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AC108941.1-201ENST00000502853 530 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AC021146.7-201ENST00000509604 775 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SS18Q15532 SNORA70.17-201ENST00000516449 133 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SS18Q15532 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AC103853.1-201ENST00000520588 649 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AC068992.1-201ENST00000521411 543 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AF117829.1-202ENST00000524166 836 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SS18Q15532 HIGD1AP10-201ENST00000527837 282 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AL121766.1-201ENST00000547436 487 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AC020891.1-201ENST00000558785 174 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AC022929.1-201ENST00000560675 823 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AC007496.1-201ENST00000565641 739 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AC099489.2-201ENST00000574976 260 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AC129492.2-201ENST00000577807 517 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SS18Q15532 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AC103987.2-201ENST00000583436 417 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AC011477.5-201ENST00000586571 259 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SS18Q15532 TTN-AS1-228ENST00000589234 751 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AC022146.1-201ENST00000595307 847 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SS18Q15532 LINC01081-201ENST00000597373 465 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AL162591.3-201ENST00000607963 681 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SS18Q15532 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SS18Q15532 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SS18Q15532 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SS18Q15532 SATB1-AS1-259ENST00000629477 853 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SS18Q15532 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
SS18Q15532 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
SS18Q15532 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AL592494.2-201ENST00000425455 1548 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SS18Q15532 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
SS18Q15532 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SS18Q15532 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SS18Q15532 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SS18Q15532 LRRC3B-205ENST00000456208 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SS18Q15532 OR5M3-201ENST00000312240 1051 ntAPPRIS P1 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SS18Q15532 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
SS18Q15532 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SS18Q15532 RNU6-532P-201ENST00000384318 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SS18Q15532 MTCO3P31-201ENST00000405526 789 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SS18Q15532 ZNF602P-201ENST00000405929 924 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SS18Q15532 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AL133343.3-201ENST00000413983 469 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AF178030.1-201ENST00000415088 402 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SS18Q15532 Z97055.1-201ENST00000419730 712 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SS18Q15532 TTC3-AS1-201ENST00000424733 1097 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AC091493.1-201ENST00000426218 411 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SS18Q15532 GNGT1-203ENST00000429473 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
SS18Q15532 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SS18Q15532 AC007563.3-201ENST00000433233 371 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SS18Q15532 LPP-AS1-201ENST00000434996 494 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.9 ms