Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 AC008738.1-201ENST00000590117 375 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 AC006557.3-201ENST00000592926 517 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 AC092106.3-201ENST00000611308 722 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 AC078899.5-201ENST00000612475 178 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 AL049794.2-201ENST00000616301 365 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 C8orf89-202ENST00000624510 658 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 CU634019.2-201ENST00000625184 593 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 OR5T1-201ENST00000641368 1118 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 CDH8-205ENST00000577730 8009 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 TMEM71-201ENST00000356838 1993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 TAS2R30-201ENST00000539585 1687 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 ADGRG4-201ENST00000370652 9820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 TEX26-201ENST00000380473 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 KPNA2P2-201ENST00000419546 1489 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 MIR1178-201ENST00000408396 91 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 PRR21-201ENST00000408934 1170 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 RPL22P18-201ENST00000417197 377 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 AL122010.1-201ENST00000429293 720 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 RPS27AP12-201ENST00000429552 465 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 AL158835.2-201ENST00000430970 300 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 AC006967.1-201ENST00000467608 589 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 AC022034.3-201ENST00000471393 478 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 AC091212.1-201ENST00000474798 395 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 AC108022.1-201ENST00000493466 478 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 AC106821.1-201ENST00000502861 572 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 WBP1LP4-201ENST00000505043 344 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 AC116353.3-201ENST00000511215 249 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 AC126768.1-201ENST00000511698 490 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 AC091435.2-201ENST00000514586 565 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 RNU2-30P-201ENST00000516209 141 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 RNA5SP34-201ENST00000516887 130 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 AC062004.1-201ENST00000518706 686 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 AC100770.1-201ENST00000532310 322 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 AC073864.1-201ENST00000540161 562 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 OR6C73P-201ENST00000546432 358 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 AC074031.1-201ENST00000550634 734 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 AC012464.2-201ENST00000551257 779 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 AL359232.1-201ENST00000556361 442 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 AC012181.3-201ENST00000565861 601 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 AL121834.1-201ENST00000572284 509 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 AC007922.3-201ENST00000581648 543 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 AC209154.1-201ENST00000582156 337 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 PSMD5-AS1-203ENST00000589026 525 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 AC024592.1-202ENST00000590441 341 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 BNIP3P38-201ENST00000601117 544 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 AC022022.2-201ENST00000602989 360 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 AC107952.2-201ENST00000606048 486 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 AC007390.2-201ENST00000606229 3803 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 AC008035.1-201ENST00000607353 448 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 AC121761.2-201ENST00000617300 689 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 AL355306.2-208ENST00000634868 1251 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 AC006927.4-201ENST00000639187 543 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 FRYL-209ENST00000506685 1940 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 AC024940.1-203ENST00000398963 4423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 SUPT16HP1-201ENST00000537175 3133 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 UGT2A3-201ENST00000251566 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 HHLA2-210ENST00000491820 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 OR2J3-201ENST00000377169 1325 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 OR56B2P-201ENST00000317102 954 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 MIR448-201ENST00000362131 111 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 TAF9BP1-201ENST00000396646 746 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 AC062016.2-201ENST00000420950 676 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 AL451127.1-201ENST00000422909 624 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 XKRYP1-201ENST00000423438 492 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.6 ms