Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 LINC02045-201ENST00000460324 679 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
R3HDM1Q15032 AC093770.1-201ENST00000511559 571 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
R3HDM1Q15032 AC067904.2-201ENST00000517322 1283 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
R3HDM1Q15032 CASP1-216ENST00000534497 825 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
R3HDM1Q15032 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
R3HDM1Q15032 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
R3HDM1Q15032 AC026474.1-201ENST00000562422 428 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
R3HDM1Q15032 AC009852.2-201ENST00000567898 485 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
R3HDM1Q15032 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
R3HDM1Q15032 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
R3HDM1Q15032 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
R3HDM1Q15032 AC103810.2-203ENST00000584959 631 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
R3HDM1Q15032 AC091132.5-204ENST00000586348 630 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
R3HDM1Q15032 SATB1-AS1-222ENST00000600177 751 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
R3HDM1Q15032 AL034549.1-201ENST00000615120 578 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
R3HDM1Q15032 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
R3HDM1Q15032 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
R3HDM1Q15032 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
R3HDM1Q15032 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
R3HDM1Q15032 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
R3HDM1Q15032 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
R3HDM1Q15032 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
R3HDM1Q15032 CREM-206ENST00000354759 1589 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
R3HDM1Q15032 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
R3HDM1Q15032 CYP3A43-201ENST00000222382 1515 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
R3HDM1Q15032 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
R3HDM1Q15032 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
R3HDM1Q15032 SLC2A3P1-201ENST00000519666 1451 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
R3HDM1Q15032 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
R3HDM1Q15032 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
R3HDM1Q15032 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
R3HDM1Q15032 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
R3HDM1Q15032 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
R3HDM1Q15032 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
R3HDM1Q15032 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
R3HDM1Q15032 LINC01204-202ENST00000435394 2214 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
R3HDM1Q15032 CPXCR1-201ENST00000276127 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
R3HDM1Q15032 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
R3HDM1Q15032 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
R3HDM1Q15032 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
R3HDM1Q15032 RBMS1-203ENST00000409075 1550 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
R3HDM1Q15032 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
R3HDM1Q15032 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
R3HDM1Q15032 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
R3HDM1Q15032 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
R3HDM1Q15032 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
R3HDM1Q15032 E2F6P2-201ENST00000420708 748 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
R3HDM1Q15032 GLUD1P9-201ENST00000420997 1173 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
R3HDM1Q15032 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
R3HDM1Q15032 MTCO1P45-201ENST00000431457 267 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
R3HDM1Q15032 NANOGP2-201ENST00000435391 727 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
R3HDM1Q15032 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
R3HDM1Q15032 Z99127.2-201ENST00000441426 334 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
R3HDM1Q15032 RPL7P9-201ENST00000468715 747 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
R3HDM1Q15032 AC087071.2-201ENST00000483283 575 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
R3HDM1Q15032 AC097512.1-203ENST00000506425 957 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
R3HDM1Q15032 AC019133.1-201ENST00000508292 420 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
R3HDM1Q15032 AC108863.1-201ENST00000520863 650 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
R3HDM1Q15032 AP002812.2-201ENST00000525594 585 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
R3HDM1Q15032 NDUFS5P6-201ENST00000529136 295 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
R3HDM1Q15032 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
R3HDM1Q15032 PDCL2P2-201ENST00000533651 189 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
R3HDM1Q15032 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
R3HDM1Q15032 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
R3HDM1Q15032 ELOCP32-201ENST00000548625 324 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
R3HDM1Q15032 AC087897.1-201ENST00000550134 156 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
R3HDM1Q15032 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
R3HDM1Q15032 SERPINE4P-201ENST00000554978 281 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
R3HDM1Q15032 AL512347.1-201ENST00000566420 503 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
R3HDM1Q15032 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
R3HDM1Q15032 CT45A3-201ENST00000597510 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
R3HDM1Q15032 AL020997.3-201ENST00000602843 359 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
R3HDM1Q15032 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
R3HDM1Q15032 AC011815.3-201ENST00000624194 473 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
R3HDM1Q15032 AC011287.1-204ENST00000640300 1213 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
R3HDM1Q15032 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
R3HDM1Q15032 OR2AP1-202ENST00000641114 1548 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
R3HDM1Q15032 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
R3HDM1Q15032 AL078595.2-201ENST00000605309 1780 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
R3HDM1Q15032 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
R3HDM1Q15032 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
R3HDM1Q15032 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
R3HDM1Q15032 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
R3HDM1Q15032 AL442128.2-201ENST00000620246 1824 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
R3HDM1Q15032 AC021086.1-201ENST00000499025 1569 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
R3HDM1Q15032 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
R3HDM1Q15032 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
R3HDM1Q15032 IL21-201ENST00000264497 629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
R3HDM1Q15032 RNU6-796P-201ENST00000391086 107 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
R3HDM1Q15032 TAF9BP2-201ENST00000400856 499 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
R3HDM1Q15032 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
R3HDM1Q15032 GLS-204ENST00000409428 816 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
R3HDM1Q15032 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
R3HDM1Q15032 AC008173.1-201ENST00000418901 264 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
R3HDM1Q15032 AC010745.4-201ENST00000420130 740 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
R3HDM1Q15032 AC092484.1-201ENST00000420548 833 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
R3HDM1Q15032 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
R3HDM1Q15032 AL589935.1-218ENST00000434683 529 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
R3HDM1Q15032 AC013410.1-201ENST00000436223 1232 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
R3HDM1Q15032 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
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