Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 AC090017.1-201ENST00000548612 1779 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 RARSP1-201ENST00000542842 1418 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AC017104.4-201ENST00000636283 1592 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AC097461.1-201ENST00000568928 2821 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 OR4A15-201ENST00000314706 1035 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 ELSPBP1-201ENST00000339841 1052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 PPIAP9-201ENST00000403866 498 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 DNAJA1P4-201ENST00000406473 1166 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AC073283.2-202ENST00000426892 591 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 PMCHL1-204ENST00000430902 659 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AL080316.1-201ENST00000432438 499 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 CYCSP24-201ENST00000445119 316 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AC009950.1-206ENST00000445199 517 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 SAMSN1-AS1-201ENST00000449214 840 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AL354754.1-201ENST00000449730 625 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AC107072.2-201ENST00000452412 555 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AZGP1P2-201ENST00000454506 345 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 UBDP1-202ENST00000457888 382 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AC017015.1-201ENST00000477387 286 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 RPL32P33-201ENST00000487023 394 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AC092916.1-201ENST00000497896 411 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AC109481.1-201ENST00000509173 282 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 ADGRL3-AS1-204ENST00000509461 481 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AC114781.3-201ENST00000512083 142 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AC139365.2-201ENST00000517972 253 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 LINC01033-204ENST00000523194 715 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AP000859.1-201ENST00000525536 307 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AC006512.2-201ENST00000543250 486 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 LINC02293-202ENST00000548385 358 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 LINC02386-201ENST00000551202 509 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AL133371.1-201ENST00000555481 764 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AL353708.2-201ENST00000567486 447 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 TTN-AS1-237ENST00000590743 812 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AC097467.3-204ENST00000595229 827 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AC008555.3-201ENST00000603717 442 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AC244100.4-201ENST00000617747 388 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 PACRG-211ENST00000621363 360 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AC116563.2-201ENST00000624751 535 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 MIR193BHG-214ENST00000641765 509 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 LPAR4-205ENST00000614823 2155 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AC234781.1-202ENST00000412436 1329 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AL731566.1-201ENST00000620490 1937 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AC025125.1-201ENST00000624743 1922 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 BMPR1APS1-201ENST00000403332 1598 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 MTERF1-202ENST00000406735 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 DDX6-207ENST00000617381 2883 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 RNU6-729P-201ENST00000384399 107 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 MAST4-207ENST00000407621 559 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms