Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 CLEC7A-203ENST00000310002 425 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 KCNRG-202ENST00000360473 1623 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 SPAG5-AS1-202ENST00000424210 1551 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 NPM1P48-201ENST00000436002 853 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 LINC02113-201ENST00000510302 336 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 GLYCAM1-202ENST00000546607 553 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 AC079328.3-201ENST00000558905 691 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 AC012409.1-201ENST00000560176 358 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 MYOCOS-203ENST00000637303 564 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 BCLAF1-214ENST00000531224 7263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 NPSR1-AS1-205ENST00000436945 1406 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 AC091862.1-201ENST00000438016 1100 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 CCRL1P1-201ENST00000449542 1053 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 AC233982.1-201ENST00000451247 436 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 AC118465.1-201ENST00000513820 1271 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 HMMR-AS1-202ENST00000521666 800 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 AC013714.1-201ENST00000524707 747 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 AL121766.1-201ENST00000547436 487 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 UGT2B17-201ENST00000317746 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 AL121834.1-202ENST00000404494 277 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 OR6C64P-201ENST00000419708 825 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 MED4-AS1-201ENST00000422483 542 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 RPF2P1-201ENST00000424137 906 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 C21orf91-OT1-202ENST00000430815 717 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 AC074367.1-201ENST00000438685 1125 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 AC009950.1-206ENST00000445199 517 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 AP000926.4-201ENST00000527351 454 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 OR4E2-202ENST00000641524 2855 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 FAM81B-201ENST00000283357 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 LINC00616-205ENST00000514600 2017 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 ZFHX4-207ENST00000521891 14019 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 AC017007.4-201ENST00000503353 1352 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 SLC38A9-218ENST00000512595 1756 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 AL034403.1-201ENST00000399414 885 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 RSL24D1P1-201ENST00000404972 493 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 SAMSN1-AS1-201ENST00000449214 840 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 RN7SL93P-201ENST00000463035 293 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 AC105180.1-201ENST00000523317 426 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 DISC1FP1-201ENST00000561596 545 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 AC092017.3-201ENST00000638880 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 AADAT-202ENST00000353187 2101 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 RNA5SP322-201ENST00000363617 119 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 LINC00266-4P-201ENST00000427373 842 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 MTND6P32-201ENST00000457611 483 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 AC023598.1-201ENST00000472521 361 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 AL606834.2-201ENST00000602954 668 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 AC124312.4-201ENST00000605533 310 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 ADGRL2-201ENST00000319517 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 SCAI-201ENST00000336505 12079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 TMEM71-201ENST00000356838 1993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 MEIOB-205ENST00000470044 1857 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 UBE2D2-201ENST00000253815 444 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
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