Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 TMBIM7P-201ENST00000418074 855 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 HRH4-202ENST00000426880 909 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 ZRANB2-AS2-204ENST00000430605 213 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 AL034405.1-201ENST00000432062 526 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 LINC02532-206ENST00000433965 570 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 AL591503.2-201ENST00000442314 1005 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 MTND5P2-201ENST00000442927 1142 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 PRR16-203ENST00000446965 1152 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 BX842559.2-201ENST00000451418 605 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 AC010149.1-201ENST00000455357 571 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 PLSCR5-202ENST00000482567 1018 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 LINC01327-201ENST00000498413 535 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 ERAP2-205ENST00000510309 1275 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 AC118465.1-201ENST00000513820 1271 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 HNRNPKP5-201ENST00000515300 253 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 LINC01481-201ENST00000552998 629 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 AL358333.1-201ENST00000555115 467 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 AL133457.1-201ENST00000564251 987 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 AL353708.2-201ENST00000567486 447 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 AC130371.1-204ENST00000576197 401 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 AC073091.2-201ENST00000603205 907 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 AC112230.1-201ENST00000604342 547 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 MEMO1P5-201ENST00000604810 406 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 AC112220.3-201ENST00000605502 502 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 OR6C3-202ENST00000641364 1341 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 LINC00690-201ENST00000429949 1365 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 PCDH15-203ENST00000373955 4230 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 ATP5F1P3-201ENST00000397213 657 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 TANK-206ENST00000406287 875 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 AC098820.3-201ENST00000414135 976 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 AL356056.1-206ENST00000424615 407 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 AC010132.1-201ENST00000433315 561 ntTSL 4 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 AC009963.2-201ENST00000453431 138 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 AC090686.1-201ENST00000481577 749 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 AC093909.2-201ENST00000505178 437 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 AC120193.1-201ENST00000518988 741 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 AC018616.1-201ENST00000524085 546 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 AC132219.1-201ENST00000524337 478 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 AC022081.1-201ENST00000537327 433 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 PCNPP1-201ENST00000552501 511 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
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