Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 RN7SKP247-201ENST00000411094 308 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 Z93403.1-201ENST00000411879 895 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 CBX1P3-201ENST00000413296 527 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 TBCA-206ENST00000518338 551 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 NARSP2-201ENST00000518524 679 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 AC005740.3-201ENST00000520882 344 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 AC008126.1-201ENST00000549019 480 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 AC099489.2-201ENST00000574976 260 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 AC005911.1-201ENST00000619883 456 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 CDC27P2-201ENST00000425026 1922 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 OTUD4P1-201ENST00000237841 3067 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 TAX1BP1-203ENST00000409980 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 OSBPL6-201ENST00000190611 10513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 C1orf105-203ENST00000367727 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 AL034403.1-201ENST00000399414 885 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 RPL6P9-201ENST00000466502 859 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 AC084116.2-201ENST00000520171 415 ntTSL 4 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 AP000926.4-201ENST00000527351 454 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 AL121766.1-201ENST00000547436 487 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 VPS29-210ENST00000552130 1057 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 AL355922.5-201ENST00000553534 351 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 AC009396.3-201ENST00000555680 354 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 AL158062.1-201ENST00000619632 745 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 KLRC1-201ENST00000347831 1332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 ADGRL2-201ENST00000319517 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 AC008278.2-201ENST00000438178 409 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 AC097262.1-201ENST00000452559 548 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 AC068196.1-201ENST00000456895 833 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 GTPBP8-204ENST00000467752 686 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 ACTG1P13-201ENST00000486987 1043 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 AC021086.1-201ENST00000499025 1569 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 CASP1-216ENST00000534497 825 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 HAUS1-203ENST00000585518 506 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 BNIP3P38-201ENST00000601117 544 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 AC079880.2-201ENST00000603790 1213 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 DAOA-AS1_2.2-201ENST00000610818 204 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 AC243756.2-201ENST00000618406 463 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 SLC38A9-223ENST00000515629 2673 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 NMD3P1-201ENST00000439704 1488 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 AL033397.1-201ENST00000502390 3653 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 RNU1-89P-201ENST00000384592 164 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 SNORA79B-201ENST00000410557 148 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 LINC00845-201ENST00000417931 696 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 PLCE1-AS2-201ENST00000419353 459 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 SKP1P1-201ENST00000438081 489 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 RN7SL809P-201ENST00000482040 297 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 RPL7P38-201ENST00000488396 739 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 RPS6P4-201ENST00000494693 758 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 AC097480.1-201ENST00000509416 712 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 IGHV3-32-201ENST00000519182 355 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 AC078906.1-201ENST00000523602 798 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 WNK3-202ENST00000375159 5403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 RPAP2-203ENST00000610020 16993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 OR51A2-201ENST00000380371 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 AC009950.1-206ENST00000445199 517 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 MTCO3P16-201ENST00000454456 754 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 AC097103.2-204ENST00000510068 569 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 AC013762.1-201ENST00000531136 467 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
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