Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 MIR4260-201ENST00000583107 67 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 AC007448.2-201ENST00000583452 380 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 AC012588.1-201ENST00000583852 358 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 Z98949.1-203ENST00000597284 851 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 AC145423.1-201ENST00000605712 336 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 CDC37L1-AS1-202ENST00000609131 235 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 Z98949.1-207ENST00000609157 814 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 AL732618.1-201ENST00000623251 301 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 AC002429.2-202ENST00000637269 394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 UGT2B4-207ENST00000639621 1154 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 XPOTP1-201ENST00000443317 2398 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 OR5M3-202ENST00000641993 1400 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 AC005725.1-201ENST00000577346 2607 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 TPTE2-201ENST00000255310 1562 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 AC131971.1-201ENST00000332881 1482 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 ZSCAN26-201ENST00000316606 2362 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 AC087257.1-201ENST00000506925 2639 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 PLEKHS1-205ENST00000369312 3443 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 OR2AE1-201ENST00000316368 1071 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 OR6C2-201ENST00000322678 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 LINC00342-201ENST00000412393 654 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 MYL6P5-201ENST00000412707 459 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 AMD1P2-201ENST00000412936 992 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 SLC8A1-AS1-201ENST00000413479 800 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 BX510359.3-201ENST00000422168 306 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 TRAPPC2P5-201ENST00000426293 308 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 CBX1P1-201ENST00000440184 427 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 AL663074.2-201ENST00000440621 479 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 HCG14-201ENST00000444986 413 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 IMMP2L-205ENST00000450877 761 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 CLEC2A-202ENST00000455827 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 AC094108.1-201ENST00000502494 527 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 LINC01181-201ENST00000503718 556 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 AC111000.4-201ENST00000504301 569 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 AC018797.3-201ENST00000513388 1241 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 AC096577.1-202ENST00000515649 448 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 RNU6-615P-201ENST00000516065 106 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 AC009623.1-201ENST00000517964 1131 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 AC079209.1-202ENST00000521953 522 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 OR5M1-201ENST00000526538 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 AL354920.1-202ENST00000531661 1017 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
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HOXA3O43365 AC099313.1-201ENST00000568437 452 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 MIR4443-201ENST00000585052 53 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 TEX26-AS1-204ENST00000585582 853 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 ZNF682-204ENST00000593468 581 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 AC092683.1-203ENST00000594050 654 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 GMFG-212ENST00000602185 423 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 AL157938.3-201ENST00000502188 3084 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 MEIOB-201ENST00000325962 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
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