Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 MIR513A2-201ENST00000385249 127 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 DEFB133-201ENST00000398721 186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 PNRC2P1-201ENST00000423940 420 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 AC003991.1-202ENST00000447058 777 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 AC023050.1-201ENST00000498198 304 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 AC107027.1-201ENST00000503006 575 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 LINC01088-205ENST00000509088 756 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 MAL2-205ENST00000521048 575 ntTSL 4 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 OR5AK3P-201ENST00000527486 1297 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 GCSAML-207ENST00000527541 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 AC079148.1-201ENST00000565944 819 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 HNRNPCP4-201ENST00000571636 900 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 AC053481.3-201ENST00000577881 843 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 PCNAP1-202ENST00000595299 752 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 ZNF432-203ENST00000597273 624 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 AL451086.1-201ENST00000605596 223 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 AL008729.2-201ENST00000606393 473 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 AC012603.1-201ENST00000606424 528 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 AL008729.1-201ENST00000606627 553 ntTSL 4 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 AC006946.3-201ENST00000609791 756 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 AL445493.3-201ENST00000619568 477 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 AL358975.1-202ENST00000628133 589 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 AC245427.3-201ENST00000632041 51 ntAPPRIS P1 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 AL773545.4-201ENST00000637262 310 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 AL513478.4-201ENST00000641636 310 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 PHF20L1-210ENST00000395390 5900 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 AC027290.2-201ENST00000623210 18662 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 LINC01247-201ENST00000448901 4209 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 MAPK10-253ENST00000641010 4072 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 OR52E6-202ENST00000379946 954 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 TTC3-AS1-201ENST00000424733 1097 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 OR5BE1P-201ENST00000425977 939 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 AC005189.1-201ENST00000431286 310 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 GOT2P5-201ENST00000433995 546 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 ELOCP8-201ENST00000439309 332 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 ELOCP15-201ENST00000442090 332 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 ARL5AP2-201ENST00000444698 533 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 AL121760.1-201ENST00000447206 346 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 RNU6-1102P-201ENST00000516149 96 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 AC027031.1-201ENST00000517318 489 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 NDUFA5P2-201ENST00000519723 344 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 AC023442.3-203ENST00000530946 533 ntTSL 4 BASIC4□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 AC079598.1-201ENST00000548691 554 ntTSL 4 BASIC4□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 AC091117.2-201ENST00000560324 542 ntTSL 4 BASIC4□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 AC016134.1-201ENST00000565259 701 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 AC107982.3-201ENST00000584957 985 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 AL451044.1-201ENST00000604867 238 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 AP006248.3-201ENST00000623580 594 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 AC073592.7-201ENST00000623659 507 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 OR5BE1P-202ENST00000641168 1176 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 PLCL2-202ENST00000432376 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 AC104662.3-202ENST00000507794 4055 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC4□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 AC097504.1-201ENST00000515103 2415 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 UGT2A3-201ENST00000251566 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 MIR1303-201ENST00000408625 86 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 AL133343.3-201ENST00000413983 469 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 AC023128.2-201ENST00000420880 1223 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 AL031736.2-201ENST00000426573 787 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 HRH4-202ENST00000426880 909 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 LINC01745-201ENST00000430921 372 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 AC074367.1-201ENST00000438685 1125 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 AC083863.1-201ENST00000438811 231 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 AL355601.1-201ENST00000444701 427 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 LINC00440-201ENST00000446579 734 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 AC009987.1-201ENST00000446888 806 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 AC020719.1-201ENST00000448977 518 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
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