Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 AC005086.4-201ENST00000623065 213 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 CHRM3-AS2-209ENST00000628573 766 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 OR4A15-202ENST00000641526 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.05□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 AL022393.1-201ENST00000625142 1677 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 OR4E2-202ENST00000641524 2855 ntAPPRIS P1 BASIC2.05□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 RBMY1KP-201ENST00000423480 476 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 ASH1L-IT1-201ENST00000458371 448 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 AC005351.1-201ENST00000511152 786 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 MYRFL-202ENST00000535034 881 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 AC010528.1-201ENST00000568714 739 ntTSL 4 BASIC2.05□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 PHACTR2P1-201ENST00000605639 1414 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 HUWE1-203ENST00000342160 14796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 OR6C3-202ENST00000641364 1341 ntAPPRIS P1 BASIC2.04□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 ZNF266-207ENST00000592904 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 S100A10-201ENST00000368809 616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 TXN-201ENST00000374515 635 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.04□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 TPT1P1-201ENST00000458495 518 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 AC069360.1-201ENST00000503469 431 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 ASAH1-263ENST00000637872 886 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 MUC5B-204ENST00000529681 17911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 OTC-201ENST00000039007 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 ASXL2-201ENST00000336112 8889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 BCLAF1-214ENST00000531224 7263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 MGAT4A-204ENST00000414521 3709 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 RPL7P38-201ENST00000488396 739 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 SETP12-201ENST00000514068 805 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 AC011611.4-201ENST00000547721 779 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 COX6CP4-201ENST00000605798 228 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 AC021086.1-201ENST00000499025 1569 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 DNAH2-201ENST00000389173 13505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 NAV2-202ENST00000360655 10667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 AC005828.3-201ENST00000583552 591 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
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HERC1Q15751 AC024603.1-201ENST00000597938 592 ntTSL 4 BASIC2.04□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 FAM26D-202ENST00000368597 1311 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC2.04□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 AL358178.1-201ENST00000407698 397 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 PRKG1-AS1-202ENST00000426785 1111 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 AC079907.2-202ENST00000547004 423 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 LINC00836-203ENST00000628620 1179 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 TLR8-202ENST00000311912 3367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 AC092079.1-201ENST00000558620 1985 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 KAT6A-202ENST00000396930 9285 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
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