Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 OR4K13-202ENST00000641664 5980 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 MLF1-208ENST00000478894 1372 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 BCAP29-203ENST00000379119 5773 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 DSCR8-202ENST00000400477 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 RNA5SP104-201ENST00000410989 118 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 OSTCP5-201ENST00000425293 453 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 AC010469.1-201ENST00000463864 576 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 AC018752.1-201ENST00000507813 206 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 DPRXP4-201ENST00000578053 568 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 AL122125.1-201ENST00000616999 600 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 TMEM67-202ENST00000409623 3255 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 HSPE1P22-201ENST00000456856 327 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 CCNHP1-201ENST00000513311 678 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 AC105339.2-201ENST00000558342 1091 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 MIR7515HG-239ENST00000591053 1113 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 AC024603.1-201ENST00000597938 592 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 AC004241.3-201ENST00000611728 517 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 GTF2H1-204ENST00000524753 1510 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 DDX4-211ENST00000511853 1984 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 SPAG5-AS1-202ENST00000424210 1551 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 FBXO8-205ENST00000615392 1591 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 OR4E2-202ENST00000641524 2855 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 OR5W2-201ENST00000344514 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 AL691447.1-201ENST00000419456 387 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 AL050338.1-201ENST00000445585 786 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 AC092925.1-201ENST00000470739 493 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 AL365356.5-201ENST00000478294 697 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 RPS26P15-201ENST00000488067 348 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 DWORF-201ENST00000489090 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 AC097372.3-201ENST00000503593 522 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 AC010342.1-201ENST00000514047 877 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 LINC02131-201ENST00000563289 419 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 AP005120.1-202ENST00000584321 506 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 GPR180-201ENST00000376958 8822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 IPCEF1-210ENST00000519344 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 OR2H1-202ENST00000377133 3021 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 ALG14-201ENST00000370205 9367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 IGF2BP3-218ENST00000619562 2126 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 OR2AP1-202ENST00000641114 1548 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 AC093849.1-201ENST00000563631 2209 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 OR4F6-201ENST00000328882 1238 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 RNA5SP39-201ENST00000411245 120 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 Z93403.1-201ENST00000411879 895 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 LINC00446-201ENST00000414743 459 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 UBE2V1P1-201ENST00000430836 445 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 AL645931.1-201ENST00000439737 410 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 PDCD10-207ENST00000471885 764 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 AC073522.1-201ENST00000483312 377 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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PTCH1Q13635 LINC02565-201ENST00000592678 478 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 AC092316.1-201ENST00000598703 297 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 AC128687.2-201ENST00000609657 566 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 AC119674.1-212ENST00000641155 993 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 THEMIS-202ENST00000368250 4101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 CCSER1-201ENST00000432775 3927 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 AC027290.2-201ENST00000623210 18662 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 OR2AP1-201ENST00000321688 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 PLET1-201ENST00000338832 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 BX119904.1-201ENST00000432026 348 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 AL139002.1-201ENST00000435281 902 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 AC002553.2-201ENST00000453217 340 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTCH1Q13635 HDAC2-AS2-209ENST00000519270 1244 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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