Protein–RNA interactions for Protein: O00287

RFXAP, Regulatory factor X-associated protein, humanhuman

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAPO00287 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RFXAPO00287 AC010928.3-201ENST00000587712 541 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RFXAPO00287 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RFXAPO00287 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RFXAPO00287 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RFXAPO00287 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RFXAPO00287 AL121890.2-201ENST00000617644 465 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RFXAPO00287 AC068831.8-201ENST00000620171 435 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RFXAPO00287 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RFXAPO00287 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RFXAPO00287 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RFXAPO00287 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RFXAPO00287 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
RFXAPO00287 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RFXAPO00287 MTCO1P6-201ENST00000481192 1384 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RFXAPO00287 FAM197Y8-201ENST00000426661 2340 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RFXAPO00287 FAM197Y6-202ENST00000442145 2340 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RFXAPO00287 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
RFXAPO00287 MTRNR2L7-201ENST00000544824 1535 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RFXAPO00287 ZNF682-209ENST00000597972 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
RFXAPO00287 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
RFXAPO00287 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
RFXAPO00287 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
RFXAPO00287 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RFXAPO00287 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
RFXAPO00287 EIF4E-203ENST00000450253 11523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
RFXAPO00287 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
RFXAPO00287 C4orf36-203ENST00000473559 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RFXAPO00287 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RFXAPO00287 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
RFXAPO00287 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
RFXAPO00287 AL606516.1-201ENST00000455438 1861 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RFXAPO00287 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RFXAPO00287 ZNF266-207ENST00000592904 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
RFXAPO00287 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RFXAPO00287 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
RFXAPO00287 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
RFXAPO00287 C1orf162-201ENST00000343534 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
RFXAPO00287 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
RFXAPO00287 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RFXAPO00287 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RFXAPO00287 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RFXAPO00287 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
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RFXAPO00287 AL354868.1-201ENST00000417077 482 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RFXAPO00287 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RFXAPO00287 RPS27AP6-201ENST00000427962 448 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RFXAPO00287 CASP12-204ENST00000433738 709 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
RFXAPO00287 AL450992.2-201ENST00000434182 506 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RFXAPO00287 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
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RFXAPO00287 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
RFXAPO00287 AC239367.2-201ENST00000447309 705 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RFXAPO00287 AC073284.1-201ENST00000448086 404 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
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RFXAPO00287 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
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RFXAPO00287 OR4F17-202ENST00000585993 2669 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RFXAPO00287 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RFXAPO00287 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
RFXAPO00287 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
RFXAPO00287 TPK1-207ENST00000538212 2243 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RFXAPO00287 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
RFXAPO00287 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
RFXAPO00287 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RFXAPO00287 FGL2-201ENST00000248598 4261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
RFXAPO00287 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
RFXAPO00287 SLC12A1-201ENST00000330289 1764 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
RFXAPO00287 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
RFXAPO00287 NCOA4P2-201ENST00000340589 1813 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
RFXAPO00287 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
RFXAPO00287 PAK3-202ENST00000360648 2241 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
RFXAPO00287 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
RFXAPO00287 SLFN12-201ENST00000304905 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
RFXAPO00287 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
RFXAPO00287 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
RFXAPO00287 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
RFXAPO00287 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
RFXAPO00287 RNA5SP332-201ENST00000391063 115 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
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