Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 AC234782.4-201ENST00000417646 1048 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 BBIP1-203ENST00000423273 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 AC015971.1-204ENST00000424788 1147 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 AL138789.1-201ENST00000425820 960 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 AC093581.1-202ENST00000430890 391 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 AL138759.1-201ENST00000432120 645 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 AC005358.1-201ENST00000445508 1143 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 AL354754.1-201ENST00000449730 625 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 AC026347.1-201ENST00000463255 474 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 GAPDHP36-201ENST00000480688 918 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 RN7SL271P-201ENST00000487601 295 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 CD200R1-205ENST00000490004 778 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 AC096576.3-201ENST00000505528 721 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 MTND3P24-201ENST00000506306 329 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 AC108156.1-201ENST00000507849 481 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 NPY1R-204ENST00000509586 1017 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 IGKV2-38-201ENST00000517443 247 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 AC073864.1-201ENST00000540161 562 ntTSL 4 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 PDCD5P1-201ENST00000543528 309 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 CSNK1A1P1-202ENST00000563423 981 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 AP001172.1-201ENST00000602921 581 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 AL034549.1-201ENST00000615120 578 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 AP003072.4-201ENST00000624580 310 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 TATDN1-221ENST00000630259 915 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 AC083865.1-201ENST00000636634 831 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 AL596275.2-206ENST00000641957 626 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 SELENOI-201ENST00000260585 8101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 GPR171-201ENST00000309180 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 LINC02120-201ENST00000505518 2008 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 AL049555.1-201ENST00000562834 1933 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CDKN3Q16667 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 OTOGL-202ENST00000458043 8083 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 AL591441.1-201ENST00000618108 2247 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 SYF2-202ENST00000354361 926 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 TEX30-204ENST00000376027 1106 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 RNU6-98P-201ENST00000384173 107 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 TRAV14DV4-201ENST00000390440 425 ntAPPRIS P1 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 TAS2R19-201ENST00000390673 1002 ntAPPRIS P1 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 PLCE1-AS2-201ENST00000419353 459 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 LINC01208-202ENST00000434969 827 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 LINC01967-202ENST00000437506 515 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 RRM2P4-201ENST00000441721 562 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 LINC00412-201ENST00000444744 420 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 BX119904.2-201ENST00000446495 512 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 FABP3P2-201ENST00000453169 399 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 RPL23AP2-201ENST00000471227 466 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 AC022034.3-201ENST00000471393 478 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 FAM104B-204ENST00000472571 1109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 RNA5SP143-201ENST00000516936 115 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 AC104350.1-201ENST00000518750 877 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 TMEM68-206ENST00000519784 1009 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 AP001636.3-202ENST00000525714 894 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 AC073525.1-202ENST00000550049 732 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 ZNF92P2-201ENST00000600543 1059 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 AC079880.2-201ENST00000603790 1213 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 AC104662.1-201ENST00000604448 511 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 C5orf63-207ENST00000606937 607 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 AC017076.1-201ENST00000607613 578 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 AC090912.3-201ENST00000609775 533 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 GHR-208ENST00000612382 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 PACRG-211ENST00000621363 360 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 AL161616.2-201ENST00000622001 565 ntTSL 4 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 SNHG5-221ENST00000624295 632 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 AL356094.1-201ENST00000624663 1212 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 BMS1P21-201ENST00000634565 365 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 ADGRL2-205ENST00000370717 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 ZFHX4-207ENST00000521891 14019 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 AC016588.2-201ENST00000632484 3021 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 ARID2-205ENST00000444670 7316 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 HSPA8P19-201ENST00000505359 1517 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 AC134882.1-201ENST00000603738 1676 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 MYOZ2-201ENST00000307128 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 OR6C2-201ENST00000322678 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 CGA-201ENST00000369582 729 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.3 ms