Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 AC104297.1-201ENST00000393779 870 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 AL512625.3-204ENST00000438699 1031 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 TPTE2P3-201ENST00000441562 1189 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 VN1R25P-201ENST00000443385 738 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 VN1R40P-201ENST00000455196 941 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 AC069306.1-201ENST00000507006 843 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 MYLK-AS2-202ENST00000515464 754 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 GLIPR1L1-204ENST00000548623 484 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 AC090403.1-205ENST00000580883 516 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 DYNAP-202ENST00000585973 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 MGA-202ENST00000545763 11413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 CYP3A7-CYP3A51P-201ENST00000611620 1608 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 SLC38A9-223ENST00000515629 2673 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 ELOCP18-201ENST00000434209 337 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 AL831737.1-201ENST00000441288 271 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 AL049552.1-201ENST00000444302 577 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 PRR16-203ENST00000446965 1152 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 AC073587.1-201ENST00000447093 876 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 LINC01158-205ENST00000458253 747 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 OR9N1P-201ENST00000491296 333 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 AC010285.3-201ENST00000511668 676 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 IGHV3-63-201ENST00000518422 341 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 AC018442.3-201ENST00000523025 183 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 CT45A3-201ENST00000597510 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 AC068790.5-201ENST00000602741 355 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 MTCO3P22-201ENST00000603219 784 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 AC010680.3-201ENST00000604215 520 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 CT45A2-201ENST00000605791 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 AP000255.1-201ENST00000610276 676 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 PNPLA8-204ENST00000426128 4268 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 AC093775.1-201ENST00000624154 1868 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 ADGRL2-211ENST00000370730 6173 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 DCDC1-211ENST00000597505 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 OR51A7-201ENST00000359350 1048 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 OR51A2-201ENST00000380371 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 AL049649.1-202ENST00000412405 414 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 KCTD9P3-201ENST00000434597 1169 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 AC092447.2-201ENST00000435487 669 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 AC078993.1-203ENST00000435789 1037 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 AL023584.2-201ENST00000454411 444 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 C1GALT1C1L-201ENST00000475092 1172 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 MGAT4D-203ENST00000511113 1125 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 HMGB1P19-201ENST00000517578 577 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 AC025857.1-201ENST00000525252 377 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 AL390816.3-201ENST00000604527 1066 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 NF1P10-201ENST00000613227 742 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 AC068254.2-201ENST00000623938 3577 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 TCEAL7-201ENST00000332431 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 RNA5SP105-201ENST00000391123 113 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 AL160275.2-201ENST00000412010 394 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 HSFY4P-201ENST00000415994 1181 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 AC245054.1-201ENST00000420944 258 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 RPL5P23-201ENST00000496040 868 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 AC139783.2-201ENST00000504847 1145 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 RPS27AP18-201ENST00000515536 459 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 MYL12AP1-201ENST00000518490 515 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 AC026888.1-201ENST00000553348 559 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 AC006116.10-201ENST00000591836 581 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 AC069209.1-201ENST00000619282 651 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
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