Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

Predictions only

Length 1,352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 SLC38A11-204ENST00000409662 1542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 KAT6A-202ENST00000396930 9285 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 ESD-201ENST00000378697 1079 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 RN7SKP33-201ENST00000410942 340 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 RPL21P108-201ENST00000413857 481 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 AL354868.1-201ENST00000417077 482 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 AL121885.1-201ENST00000417957 451 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 AC062016.2-201ENST00000420950 676 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 AL049552.1-201ENST00000444302 577 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 KRTAP21-3-201ENST00000444335 253 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 AL359715.2-201ENST00000452402 682 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 AADACP1-204ENST00000483636 1285 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 AC091544.1-201ENST00000484702 348 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 NREP-AS1-202ENST00000507222 610 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 AC111000.3-201ENST00000508057 576 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 LINC00589-202ENST00000518623 938 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 DISC1FP1-201ENST00000561596 545 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 AL109618.2-201ENST00000605527 211 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 AC024941.1-201ENST00000612250 334 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 AC092329.3-201ENST00000611392 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 NSF-206ENST00000575068 2667 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 CNGA1-202ENST00000402813 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 MSANTD2-204ENST00000526629 3086 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 C2orf66-201ENST00000342506 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 AC007159.1-201ENST00000566529 4706 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 AL354696.2-201ENST00000619407 1910 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 UGP2-203ENST00000445915 1955 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 CSMD2-206ENST00000373388 13118 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 MTCO3P31-201ENST00000405526 789 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 CACYBP-203ENST00000406752 243 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 AC068483.1-201ENST00000413403 660 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 RPS7P13-201ENST00000413955 498 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 AC068287.1-201ENST00000430283 295 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 AC004980.3-201ENST00000447046 365 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 LINC00393-202ENST00000452852 485 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 ARPC3P2-201ENST00000457786 533 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 RPS7P7-201ENST00000463499 571 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 AC090013.1-201ENST00000485147 480 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 AC108062.1-201ENST00000505133 637 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 THAP6-209ENST00000507556 1134 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 RPL7L1P13-201ENST00000511702 739 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 AL163932.1-201ENST00000555776 542 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 AC109462.2-201ENST00000558730 763 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 RN7SL802P-201ENST00000577858 299 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 AC105094.2-203ENST00000590357 555 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 AC020914.6-201ENST00000594327 272 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 MMP13-203ENST00000615555 1152 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 AC005899.7-201ENST00000618199 588 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 AC244472.1-201ENST00000620773 347 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 C3orf67-209ENST00000482387 2617 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 LINC02240-201ENST00000564199 1336 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
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