Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 LINC01491-202ENST00000558792 439 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 AC068714.1-201ENST00000559623 800 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 AP005262.1-201ENST00000582646 997 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 AC091946.2-201ENST00000606105 291 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 AL353600.1-201ENST00000608148 251 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 AC234782.5-201ENST00000617723 324 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 AC116563.2-201ENST00000624751 535 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 LINC01709-202ENST00000635702 1204 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 C3orf67-209ENST00000482387 2617 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 CSTA-201ENST00000264474 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 RN7SKP106-201ENST00000410832 272 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 RSU1P3-201ENST00000412878 835 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 AC018832.1-201ENST00000428171 566 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 AC023590.1-204ENST00000434023 431 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 AP001434.1-201ENST00000444977 287 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 AL034380.1-201ENST00000448791 306 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 AL157359.1-201ENST00000449840 424 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 SEPT7P3-201ENST00000455017 621 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 RPS4XP12-201ENST00000461747 709 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 RPSAP51-201ENST00000497462 645 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 ARL4AP1-201ENST00000503220 705 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 LINC02113-201ENST00000510302 336 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 AC108866.1-202ENST00000511064 573 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 AF279873.1-201ENST00000523393 313 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 AF117829.1-210ENST00000523859 696 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 HIGD1AP10-201ENST00000527837 282 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 AC009562.1-202ENST00000558755 565 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 AC074237.1-201ENST00000577674 471 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 NUFIP2-202ENST00000579665 559 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 AC067968.2-201ENST00000592583 566 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 AC007497.1-201ENST00000610421 561 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 AL359715.5-201ENST00000623431 443 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 OR10A6-202ENST00000623991 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 AC073869.7-201ENST00000640874 297 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 TRIM51GP-201ENST00000534741 1350 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 AC011287.1-206ENST00000638774 2642 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 PALMD-203ENST00000605497 1942 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 ALS2CR12-201ENST00000286190 1769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 DHX40P1-201ENST00000588725 1412 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 PLS1-211ENST00000497002 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 AL035079.1-201ENST00000405210 287 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 AL020993.1-201ENST00000420172 297 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 CENPIP1-201ENST00000425713 902 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 VDAC1P6-201ENST00000430062 855 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 RPS26P40-201ENST00000435209 294 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 AC016644.1-201ENST00000438553 434 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FSCN1Q16658 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms