Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 SLC9B1P1-201ENST00000331172 1337 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FXNQ16595 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FXNQ16595 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FXNQ16595 CALCOCO2-204ENST00000448105 1916 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FXNQ16595 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
FXNQ16595 ADGRL2-202ENST00000359929 4674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
FXNQ16595 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
FXNQ16595 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FXNQ16595 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FXNQ16595 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FXNQ16595 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FXNQ16595 KLRC3-201ENST00000381903 798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
FXNQ16595 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FXNQ16595 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FXNQ16595 OR7E101P-201ENST00000400428 513 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FXNQ16595 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FXNQ16595 SNRPEP6-201ENST00000407465 277 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FXNQ16595 ATF2-205ENST00000409499 801 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
FXNQ16595 LINC01423-201ENST00000414189 608 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FXNQ16595 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FXNQ16595 THEM7P-201ENST00000419556 672 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FXNQ16595 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FXNQ16595 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AC007383.1-201ENST00000445875 636 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FXNQ16595 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FXNQ16595 FABP3P2-201ENST00000453169 399 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FXNQ16595 HCG17-214ENST00000453558 732 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AC004129.2-201ENST00000457229 287 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FXNQ16595 GLYCTK-AS1-202ENST00000472761 109 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AL117692.1-201ENST00000494283 713 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AC093824.1-201ENST00000508796 343 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FXNQ16595 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FXNQ16595 EGFLAM-AS2-201ENST00000512603 466 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FXNQ16595 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FXNQ16595 WBP1LP3-201ENST00000523033 208 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AC018616.1-201ENST00000524085 546 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FXNQ16595 TMEM126B-211ENST00000534341 1273 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AC024224.1-201ENST00000538284 609 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AC100821.2-201ENST00000565668 440 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FXNQ16595 ZNF971P-202ENST00000568619 461 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FXNQ16595 MAPKAPK5-AS1-205ENST00000590479 543 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FXNQ16595 ZNF208-204ENST00000599916 740 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FXNQ16595 LAMTOR5-AS1-217ENST00000608152 407 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FXNQ16595 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FXNQ16595 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
FXNQ16595 PCBP1-AS1-282ENST00000625783 826 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FXNQ16595 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FXNQ16595 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
FXNQ16595 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FXNQ16595 USP37-205ENST00000454775 5019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FXNQ16595 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FXNQ16595 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FXNQ16595 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
FXNQ16595 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FXNQ16595 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
FXNQ16595 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
FXNQ16595 RNU1-130P-201ENST00000363930 160 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FXNQ16595 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FXNQ16595 GKN1-201ENST00000377938 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
FXNQ16595 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FXNQ16595 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FXNQ16595 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FXNQ16595 RNA5SP198-201ENST00000410376 127 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FXNQ16595 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AL451081.1-201ENST00000413159 245 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FXNQ16595 LINC01811-201ENST00000415991 594 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FXNQ16595 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FXNQ16595 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AL590609.2-201ENST00000421430 368 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FXNQ16595 LINC01690-201ENST00000424837 576 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AL669841.1-201ENST00000425723 558 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FXNQ16595 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FXNQ16595 OR4F13P-201ENST00000428478 931 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AC092168.2-201ENST00000430586 717 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FXNQ16595 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AL663074.2-201ENST00000440621 479 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AL929236.1-201ENST00000443622 518 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FXNQ16595 RPS20P21-201ENST00000466859 343 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FXNQ16595 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FXNQ16595 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AC104411.1-201ENST00000480817 320 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.4 ms