Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 VDAC1P9-201ENST00000412766 841 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 MTCYBP14-201ENST00000457471 715 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 OR6R2P-201ENST00000609216 300 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 UNC79-203ENST00000553484 9100 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 OFD1P11Y-201ENST00000418213 1177 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 AL929288.1-201ENST00000426262 746 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 AC083863.1-201ENST00000438811 231 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 AL157359.2-201ENST00000440372 784 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 AL049874.2-201ENST00000492636 288 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 AC092868.3-201ENST00000560515 784 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 AP005121.1-201ENST00000578243 469 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 AL513314.2-206ENST00000617276 434 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 AGO1-201ENST00000373204 13708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 OR2AP1-202ENST00000641114 1548 ntAPPRIS P1 BASIC2.08□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 FOXP2-205ENST00000393489 2285 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 DPP10-AS3-201ENST00000417844 665 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 EIF4A1P1-201ENST00000420241 934 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 AL645931.1-201ENST00000439737 410 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 AC034223.2-201ENST00000511840 425 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 OR5M7P-201ENST00000526140 972 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 AC127024.5-201ENST00000580085 462 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 AC006363.1-201ENST00000603806 463 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 AL033543.1-201ENST00000623440 13454 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 SLC35E3-202ENST00000398004 17791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 UBR4-204ENST00000375254 15906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 DPCR1-202ENST00000462446 5314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 AL590103.1-201ENST00000434488 307 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 ATP5C1P1-201ENST00000441945 895 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 SLC9A9-AS1-201ENST00000479030 518 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 AC011507.1-201ENST00000585364 567 ntTSL 4 BASIC2.08□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 PPP2R5C-226ENST00000557095 1307 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 DICER1-202ENST00000393063 10220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 DNM1P47-203ENST00000571780 12667 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 MUC3A-203ENST00000483366 9944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 TCEAL7-201ENST00000332431 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 RPS15AP29-201ENST00000445539 400 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 RPL23AP23-201ENST00000452590 471 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 LINC02459-201ENST00000551761 474 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 IMMP1LP1-201ENST00000605170 488 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 LINC02120-201ENST00000505518 2008 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 OR51A3P-201ENST00000413596 924 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 LIPT1P1-201ENST00000415870 1186 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 AL391645.1-201ENST00000417409 506 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 GABRG3-AS1-201ENST00000439938 970 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC2.07□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 CASC19-203ENST00000523510 575 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 AP002812.4-201ENST00000532139 286 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 AC084398.2-201ENST00000551918 564 ntTSL 4 BASIC2.07□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC2.07□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 CDYL2-207ENST00000570137 8159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 BTG4-203ENST00000525791 1394 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 AKAP6-213ENST00000557354 5259 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 GHRL-209ENST00000446937 217 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 AC124856.1-201ENST00000600819 896 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 AC138907.10-201ENST00000623708 983 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 AC134882.1-201ENST00000603738 1676 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 AL645937.1-201ENST00000641739 1652 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 ESRRG-208ENST00000391890 5542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 VPS53-204ENST00000437048 13106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 SRGAP1-207ENST00000631006 8406 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 SUPT16HP1-201ENST00000537175 3133 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
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