Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 OR2M2-203ENST00000641836 1151 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 AL049555.1-201ENST00000562834 1933 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 RPS4Y1-201ENST00000250784 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 RNU6-304P-201ENST00000364855 107 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 LINC01048-201ENST00000414480 511 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 AC004594.1-217ENST00000422260 325 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 NIPA2P1-201ENST00000426223 976 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 BMS1P19-201ENST00000433925 393 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 BTG3P1-201ENST00000435859 716 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 AC074367.1-201ENST00000438685 1125 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 AL359378.1-201ENST00000439891 400 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 NIPA2P2-201ENST00000496376 1083 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 RPS3A-204ENST00000506126 862 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 AC010451.2-201ENST00000511514 545 ntTSL 4 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 OR7E13P-201ENST00000526052 910 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 AC073172.2-201ENST00000527770 571 ntTSL 4 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 AL121766.1-201ENST00000547436 487 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 AC009803.3-201ENST00000548457 540 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 CBX3P5-201ENST00000552017 521 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 ZFAND6-204ENST00000558087 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 AC068397.1-201ENST00000560337 531 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 CYP2C60P-201ENST00000566088 139 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 AP005901.4-201ENST00000577336 569 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 AC026620.1-201ENST00000584815 326 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 AC016957.2-201ENST00000616998 848 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 AC092159.4-201ENST00000624944 550 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 RNU6-1251P-201ENST00000364502 107 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.78□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 PDC-201ENST00000391997 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 RN7SKP222-201ENST00000410651 315 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 RAB28P1-201ENST00000411517 641 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 SVIL-AS1-202ENST00000414457 1243 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 LINC00317-201ENST00000419069 612 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 AL691447.1-201ENST00000419456 387 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 LINC00266-4P-201ENST00000427373 842 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 TRIM60P9Y-201ENST00000438459 816 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 TRIM60P11Y-201ENST00000445313 801 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 MTOR-AS1-202ENST00000445982 705 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 AC099563.1-201ENST00000456086 418 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 AC109349.1-201ENST00000503299 758 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 NREP-AS1-202ENST00000507222 610 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 ZNF131-215ENST00000509931 970 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 AC108064.1-201ENST00000513791 460 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 PCAT1-201ENST00000519319 734 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 IGKV2D-10-201ENST00000520194 281 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 PTS-202ENST00000524931 696 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 EIF4A2P3-201ENST00000525903 1055 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 AC084757.1-201ENST00000559987 490 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 AL109741.3-201ENST00000561748 592 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 AC093330.1-201ENST00000583326 568 ntTSL 4 BASIC3.78□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 AC084373.1-201ENST00000603311 235 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 AC023043.4-201ENST00000612081 449 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 AC006338.2-201ENST00000616864 791 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 BX088723.1-201ENST00000637785 708 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 AC134980.1-211ENST00000638243 1094 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
TRIP13Q15645 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.81
TRIP13Q15645 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.81
TRIP13Q15645 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
TRIP13Q15645 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
TRIP13Q15645 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
TRIP13Q15645 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TRIP13Q15645 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
TRIP13Q15645 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
TRIP13Q15645 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
TRIP13Q15645 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC3.77□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.3 ms