Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 SELENOI-201ENST00000260585 8101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 DNAH6-201ENST00000237449 12666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 CD96-203ENST00000438817 1565 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 LINC00283-201ENST00000430111 1947 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 DDX18P3-201ENST00000404856 2007 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 SNORA63.3-201ENST00000362682 132 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 RPL31-206ENST00000409650 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 AC092652.1-202ENST00000413315 587 ntTSL 4 BASIC4.01□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 TTTY12-201ENST00000413466 979 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 AL354692.1-201ENST00000423044 315 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 HSFY1P1-201ENST00000423928 1178 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 MTCO2P1-201ENST00000424648 477 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 AL138789.1-201ENST00000425820 960 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 UBE2D3P3-201ENST00000426992 425 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 OR4F13P-201ENST00000428478 931 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 AL158209.1-201ENST00000433460 439 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 ST7-AS2-203ENST00000434993 918 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 AC093716.1-201ENST00000435923 377 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 AC024084.1-201ENST00000440744 455 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 AL157827.1-201ENST00000447622 132 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 AC017067.1-201ENST00000448570 447 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 PDSS1P2-201ENST00000449397 678 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 EPPIN-WFDC6-201ENST00000504988 1156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 C1GALT1P2-201ENST00000510813 1104 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 GPX8-208ENST00000515370 1036 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 MTCYBP19-201ENST00000517463 1124 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 AC099805.1-203ENST00000518177 773 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 DUXAP2-201ENST00000519198 589 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 AL161804.1-201ENST00000555600 708 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 NPM1P47-201ENST00000560843 856 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 AC009704.1-201ENST00000583702 331 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 LINC01900-202ENST00000584898 603 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 AC068020.1-201ENST00000594215 661 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 DNAJC19P3-201ENST00000594491 331 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 AC233280.2-201ENST00000603917 1070 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 AC104662.1-201ENST00000604448 511 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 AC110792.4-201ENST00000609843 298 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 AC004241.3-201ENST00000611728 517 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 LINC00901.1-201ENST00000617252 152 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 AC023509.5-201ENST00000617434 807 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 AC124312.6-202ENST00000623624 418 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 AC007389.5-201ENST00000629214 744 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 CASC15-208ENST00000636388 1174 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 AL596275.2-206ENST00000641957 626 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 RC3H2-203ENST00000373670 9248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 TNFAIP6-201ENST00000243347 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 LINC02120-201ENST00000505518 2008 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 MAPK10-353ENST00000641803 8483 ntAPPRIS P2 BASIC4□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 ETV1-202ENST00000399357 6096 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 PCDH11X-205ENST00000373094 9179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 MGST1-201ENST00000010404 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 RNU6-650P-201ENST00000365658 111 ntBASIC4□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 GCNT6-201ENST00000379591 934 ntBASIC4□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 OR51F1-201ENST00000380383 960 ntAPPRIS P5 BASIC4□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 RNU6-761P-201ENST00000384148 107 ntBASIC4□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 MGST1-203ENST00000396207 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 AC073136.2-201ENST00000417282 849 ntBASIC4□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 HNRNPDLP3-201ENST00000456745 380 ntBASIC4□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC4□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 AC073359.2-201ENST00000478814 351 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 DEFB109F-201ENST00000491870 277 ntBASIC4□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC4□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC4□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 AC112198.4-201ENST00000515450 351 ntBASIC4□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC4□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 OPRM1-223ENST00000524163 1251 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 AC113192.3-201ENST00000529152 742 ntBASIC4□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 AC004923.2-201ENST00000529649 369 ntBASIC4□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 OR4A12P-201ENST00000530847 918 ntBASIC4□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 KBTBD3-204ENST00000531482 874 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 AC090680.2-201ENST00000550279 742 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 ETFRF1-208ENST00000556402 874 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 AL136298.1-201ENST00000557371 566 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 AC023158.1-201ENST00000561632 1025 ntBASIC4□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 AC008537.2-201ENST00000596135 482 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 AL022097.1-201ENST00000602500 806 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 BNIP3P31-201ENST00000604515 566 ntBASIC4□□□□□ -1.77
RUNX3Q13761 AL049634.3-201ENST00000604968 457 ntBASIC4□□□□□ -1.77
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