Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 IPO8P1-201ENST00000455509 3109 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 MGST1-201ENST00000010404 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 OR5M3-201ENST00000312240 1051 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 AKAP14-204ENST00000371431 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 RNU6-185P-201ENST00000384421 107 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 MGST1-203ENST00000396207 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 AL596247.1-201ENST00000416076 442 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 AL353608.1-201ENST00000419576 416 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 AC245517.2-201ENST00000442890 346 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 TXNP2-201ENST00000443918 295 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 AL355592.1-201ENST00000450292 386 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 SLC31A1P1-201ENST00000451221 567 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 MTCO3P16-201ENST00000454456 754 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 RPL23AP81-201ENST00000455252 467 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 PTCHD1-AS-201ENST00000455399 718 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 OR7L1P-201ENST00000456181 380 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 AC018742.1-202ENST00000457901 504 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 AC135457.1-201ENST00000503553 664 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 AC093720.1-201ENST00000505681 714 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 AC005351.1-201ENST00000511152 786 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 AC010245.1-201ENST00000511329 754 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 AC026726.1-201ENST00000512859 601 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 AC103739.1-201ENST00000558389 474 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 MIR548Y-201ENST00000582739 110 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 AL354984.3-201ENST00000604803 325 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 C12orf60-201ENST00000330828 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 AC018462.1-201ENST00000425966 1684 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 AL132640.2-201ENST00000559968 1698 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 AC021755.1-201ENST00000559747 1447 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 MTRNR2L13-201ENST00000604093 1445 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 MAPK10-373ENST00000641983 6772 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 PCDH15-234ENST00000622048 6820 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 AL137100.1-201ENST00000556703 1620 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 LINC01902-202ENST00000636983 4607 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 LGALS13-201ENST00000221797 602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 OR6X1-201ENST00000327930 1058 ntAPPRIS P1 BASIC4.11□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 ZBTB37-201ENST00000367701 19128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 IGKV5-2-201ENST00000390244 408 ntAPPRIS P1 BASIC4.11□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 TRBV24-1-201ENST00000390397 381 ntAPPRIS P1 BASIC4.11□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.11□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 RNU6-244P-201ENST00000391028 104 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 ATP5F1P4-201ENST00000397288 746 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 RPL23AP59-201ENST00000399415 461 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 DNAJC19P6-201ENST00000401853 280 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 CXCL8-202ENST00000401931 700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 PGBD4P8-201ENST00000412993 562 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 XKRYP4-201ENST00000414395 483 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 MTND2P16-201ENST00000419987 799 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 HMGB1P45-201ENST00000435986 653 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 AC099654.1-201ENST00000442649 407 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 AC034228.3-201ENST00000446275 562 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
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IFT88Q13099 XKRYP5-201ENST00000449659 483 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 AL512328.1-202ENST00000452640 850 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
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IFT88Q13099 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 AC093267.1-201ENST00000489176 961 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 AC025470.2-201ENST00000506106 897 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 AC104012.1-201ENST00000517848 719 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 LINC02157-201ENST00000558885 447 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 AC026462.4-201ENST00000565229 951 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 EIF1P6-201ENST00000600054 334 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 AF230666.1-202ENST00000608375 870 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC4.11□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 OR6C3-203ENST00000641740 1093 ntAPPRIS P1 BASIC4.11□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 Z82217.1-201ENST00000625157 8149 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 CREM-206ENST00000354759 1589 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 CR381670.1-201ENST00000624291 1693 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
IFT88Q13099 AC092650.1-201ENST00000447571 1808 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
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