Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 RGS10-201ENST00000369101 738 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 RRM2B-203ENST00000395912 900 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AL359643.1-201ENST00000404109 423 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AC093159.1-201ENST00000416845 424 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AC013429.2-201ENST00000418798 781 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AC009237.2-201ENST00000421358 284 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 LINC01589-201ENST00000422971 548 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AL513174.1-201ENST00000423182 629 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AC093698.1-201ENST00000423843 571 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AC092634.2-201ENST00000428146 1010 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 RPL7P59-201ENST00000447700 943 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AL035090.1-201ENST00000454835 332 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 MTCO3P35-201ENST00000485582 781 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 C1orf143-202ENST00000491260 813 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AC025674.1-201ENST00000507074 324 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AC079226.2-201ENST00000509283 518 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AC008837.1-201ENST00000511513 412 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 RNU6-1028P-201ENST00000517164 93 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AC117834.1-202ENST00000521203 561 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 TRDV3-201ENST00000535880 425 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AC092112.1-201ENST00000538329 640 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 CA1-224ENST00000542576 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AC063947.1-201ENST00000549036 557 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AC079075.1-201ENST00000559543 878 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AC007448.2-201ENST00000583452 380 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 LAMTOR5-AS1-203ENST00000585330 463 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 FAM25E-202ENST00000608562 189 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AC006386.1-201ENST00000619436 415 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AC091953.3-201ENST00000623220 236 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AC109462.4-201ENST00000637882 581 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
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FOXD4Q12950 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 POU1F1-202ENST00000350375 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
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FOXD4Q12950 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 GHR-213ENST00000622294 4312 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
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FOXD4Q12950 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 TMEM225-201ENST00000375026 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
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FOXD4Q12950 C8orf22-202ENST00000399653 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
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FOXD4Q12950 RPS6P4-201ENST00000494693 758 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 LNX1-AS2-201ENST00000502410 347 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 OR5H5P-201ENST00000503164 928 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AC091860.1-201ENST00000505723 432 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AC097515.1-202ENST00000511818 371 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
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FOXD4Q12950 AC067817.1-201ENST00000518535 356 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 PTK2-220ENST00000520151 573 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
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FOXD4Q12950 AC022360.1-201ENST00000521058 340 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 UQCRB-209ENST00000523920 695 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AC104257.1-202ENST00000524275 884 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 LRRC37A5P-202ENST00000536054 1095 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 MFAP5-212ENST00000543369 972 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AL392023.2-202ENST00000555342 494 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
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