Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AC089998.2-201ENST00000551856 277 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AL353708.2-201ENST00000567486 447 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AC091563.1-202ENST00000574086 522 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AC243756.1-201ENST00000584068 660 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AC018761.4-201ENST00000585742 272 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AC090771.2-201ENST00000588794 571 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AC008750.7-201ENST00000600765 559 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AC145207.9-201ENST00000623802 325 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 LINC00969-332ENST00000630874 738 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 TYRP1-201ENST00000381136 872 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 KRTAP3-1-201ENST00000391588 594 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 GAS5-202ENST00000414075 413 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AL596448.1-201ENST00000415024 392 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 RBMY2KP-201ENST00000418221 992 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AC099677.3-201ENST00000427081 395 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AL353662.1-201ENST00000439099 327 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 PFN1P6-201ENST00000476786 399 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AC006296.2-201ENST00000507932 764 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AC011396.3-201ENST00000508845 512 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 LSM3P2-201ENST00000551246 273 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AC107958.1-201ENST00000556576 290 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AC022884.3-201ENST00000579571 248 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AC006272.2-201ENST00000594725 163 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AC239809.3-206ENST00000596091 741 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 SNHG8-202ENST00000602483 309 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AC005392.3-201ENST00000607109 459 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 LINC02098-201ENST00000608492 475 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AL356515.1-201ENST00000611081 415 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 MIR6071-201ENST00000616741 78 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 PACRG-211ENST00000621363 360 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 CGA-206ENST00000630630 832 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AC073488.3-201ENST00000631611 778 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AC245088.3-201ENST00000634383 424 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 ARF4-206ENST00000489843 1360 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 CLUL1-205ENST00000579494 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 NOSTRIN-207ENST00000445023 1569 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 CYP7A1-201ENST00000301645 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.4 ms