Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SS18Q15532 EIF4A2P3-201ENST00000525903 1055 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SS18Q15532 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SS18Q15532 AP001001.1-202ENST00000527594 692 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SS18Q15532 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
SS18Q15532 CLEC7A-212ENST00000533022 625 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
SS18Q15532 LINC00254-201ENST00000563416 662 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SS18Q15532 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
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SS18Q15532 AC022166.1-201ENST00000567851 581 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SS18Q15532 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SS18Q15532 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SS18Q15532 AC090403.1-205ENST00000580883 516 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SS18Q15532 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SS18Q15532 AC069366.1-201ENST00000583159 838 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SS18Q15532 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SS18Q15532 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
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SS18Q15532 AC010608.2-201ENST00000624830 470 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SS18Q15532 LINC00561-201ENST00000565815 2738 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SS18Q15532 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
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SS18Q15532 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SS18Q15532 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SS18Q15532 HGF-202ENST00000354224 1425 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
SS18Q15532 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SS18Q15532 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
SS18Q15532 ZNF266-203ENST00000588933 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
SS18Q15532 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
SS18Q15532 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
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SS18Q15532 CFHR3-206ENST00000617219 1462 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SS18Q15532 C12orf60-201ENST00000330828 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
SS18Q15532 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SS18Q15532 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SS18Q15532 RPS4XP5-202ENST00000449995 1334 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SS18Q15532 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
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SS18Q15532 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
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SS18Q15532 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
SS18Q15532 NTS-201ENST00000256010 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
SS18Q15532 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SS18Q15532 OR6C3-201ENST00000379667 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SS18Q15532 PDC-201ENST00000391997 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
SS18Q15532 ENSAP1-201ENST00000392855 326 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SS18Q15532 CYB5AP4-201ENST00000396692 399 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
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