Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 ARL6IP1P2-201ENST00000431356 563 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 PIH1D2-202ENST00000431456 1245 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 LINC01611-203ENST00000454981 504 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 RN7SL727P-201ENST00000482164 296 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 LINC02283-201ENST00000511634 474 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 AC024132.3-201ENST00000513616 649 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 AC087783.1-201ENST00000527135 564 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 OR4A12P-201ENST00000530847 918 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 AP000619.3-201ENST00000535634 1127 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 LINC02423-202ENST00000542577 460 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 AC084200.1-201ENST00000547370 547 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 LINC02326-201ENST00000552028 540 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 MMP2-AS1-202ENST00000569037 553 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 AC069366.1-201ENST00000583159 838 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 AC019080.3-201ENST00000606180 444 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 AL512624.1-201ENST00000613638 469 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 AC013727.1-201ENST00000618581 839 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 CGA-206ENST00000630630 832 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 METTL15-211ENST00000634762 718 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 AC135068.12-201ENST00000637370 931 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 RUVBL2-214ENST00000640699 153 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 RBBP6-202ENST00000348022 5739 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 OR2L5-201ENST00000355281 2429 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 A2MP1-204ENST00000566278 4130 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 ARID2-205ENST00000444670 7316 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 ZC2HC1B-201ENST00000237275 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 OR2B6-201ENST00000244623 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 CLEC7A-202ENST00000304084 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 TANK-206ENST00000406287 875 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 MIR1286-201ENST00000408112 78 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 FRMPD3-AS1-201ENST00000415252 457 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 LINC01074-201ENST00000422527 555 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 AC108075.1-201ENST00000424692 529 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 LINC02476-202ENST00000431071 559 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
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BRD3Q15059 AP000477.1-202ENST00000434859 847 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 AC105271.1-201ENST00000442876 497 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 KIAA0895-209ENST00000453212 956 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 USP9YP25-201ENST00000457708 443 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
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BRD3Q15059 AC112695.1-201ENST00000504213 592 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 RPS4XP20-201ENST00000505751 772 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 RNA5SP392-201ENST00000516905 112 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 MAL2-201ENST00000522112 573 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 PTH-202ENST00000529816 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 IFNG-AS1-201ENST00000536914 494 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 AC113418.1-201ENST00000569928 517 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
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BRD3Q15059 MIR3176-201ENST00000582210 90 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 AC091057.2-201ENST00000602594 792 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 AC002128.2-201ENST00000604161 618 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 AC087783.2-201ENST00000605070 562 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
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BRD3Q15059 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 AC012593.1-211ENST00000625996 799 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 AC013470.2-206ENST00000636804 771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 MTRNR2L7-201ENST00000544824 1535 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 DCAF13P1-201ENST00000495256 1330 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 RNU1-130P-201ENST00000363930 160 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 Y_RNA.192-201ENST00000363977 102 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 MANSC4-201ENST00000381273 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 MIR921-201ENST00000401133 56 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 HSPD1P16-201ENST00000402302 394 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 RPS3AP25-201ENST00000411660 793 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 TTTY12-201ENST00000413466 979 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 AC093159.1-201ENST00000416845 424 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 PLCE1-AS2-201ENST00000419353 459 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
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