Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 AL500522.2-201ENST00000448562 343 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
R3HDM1Q15032 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
R3HDM1Q15032 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
R3HDM1Q15032 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
R3HDM1Q15032 SYPL1P1-201ENST00000473622 768 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
R3HDM1Q15032 RPL21P47-201ENST00000483696 477 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
R3HDM1Q15032 AC079203.1-201ENST00000487972 404 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
R3HDM1Q15032 NADK2-AS1-201ENST00000501794 720 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
R3HDM1Q15032 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
R3HDM1Q15032 NPY1R-204ENST00000509586 1017 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
R3HDM1Q15032 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
R3HDM1Q15032 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
R3HDM1Q15032 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
R3HDM1Q15032 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
R3HDM1Q15032 RNU6-232P-201ENST00000517144 64 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
R3HDM1Q15032 AC016074.1-201ENST00000518339 636 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
R3HDM1Q15032 TRMT10BP1-201ENST00000519377 943 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
R3HDM1Q15032 ZFAND1-217ENST00000521895 885 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
R3HDM1Q15032 AC107373.1-201ENST00000522570 603 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
R3HDM1Q15032 AC021242.2-201ENST00000522765 454 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
R3HDM1Q15032 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
R3HDM1Q15032 AP001001.1-202ENST00000527594 692 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
R3HDM1Q15032 AC004923.2-201ENST00000529649 369 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
R3HDM1Q15032 A2ML1-AS1-201ENST00000537288 452 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
R3HDM1Q15032 AC090286.3-201ENST00000573133 187 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
R3HDM1Q15032 BCAR4-204ENST00000573319 1273 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
R3HDM1Q15032 AC005034.4-201ENST00000603612 899 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
R3HDM1Q15032 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
R3HDM1Q15032 AC024060.1-201ENST00000607052 494 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
R3HDM1Q15032 LAMTOR5-AS1-227ENST00000609653 457 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
R3HDM1Q15032 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
R3HDM1Q15032 AC105227.2-201ENST00000615075 605 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
R3HDM1Q15032 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
R3HDM1Q15032 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
R3HDM1Q15032 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
R3HDM1Q15032 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
R3HDM1Q15032 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
R3HDM1Q15032 MTND5P24-201ENST00000438892 1767 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
R3HDM1Q15032 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
R3HDM1Q15032 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
R3HDM1Q15032 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
R3HDM1Q15032 AC019072.1-201ENST00000604535 1551 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
R3HDM1Q15032 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
R3HDM1Q15032 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
R3HDM1Q15032 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
R3HDM1Q15032 IFI16-202ENST00000340979 2732 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
R3HDM1Q15032 IFI16-204ENST00000368131 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
R3HDM1Q15032 CSTA-201ENST00000264474 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
R3HDM1Q15032 OR52E6-201ENST00000329322 970 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
R3HDM1Q15032 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
R3HDM1Q15032 AL035079.1-201ENST00000405210 287 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
R3HDM1Q15032 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
R3HDM1Q15032 NPM1P26-201ENST00000426339 738 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
R3HDM1Q15032 AC092920.1-201ENST00000428516 678 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
R3HDM1Q15032 VAV3-AS1-201ENST00000438318 619 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
R3HDM1Q15032 ARL5AP3-201ENST00000439327 386 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
R3HDM1Q15032 LINC00440-201ENST00000446579 734 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
R3HDM1Q15032 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
R3HDM1Q15032 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
R3HDM1Q15032 MRPL35P4-201ENST00000453682 566 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
R3HDM1Q15032 RPS6P2-201ENST00000454208 705 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
R3HDM1Q15032 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
R3HDM1Q15032 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
R3HDM1Q15032 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
R3HDM1Q15032 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
R3HDM1Q15032 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
R3HDM1Q15032 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
R3HDM1Q15032 LINC02170-201ENST00000561519 555 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
R3HDM1Q15032 AC093524.1-201ENST00000564266 1094 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
R3HDM1Q15032 AC090844.2-203ENST00000582263 632 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
R3HDM1Q15032 AC007993.3-202ENST00000585329 725 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
R3HDM1Q15032 AC011507.1-201ENST00000585364 567 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
R3HDM1Q15032 AC010127.1-205ENST00000595268 567 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
R3HDM1Q15032 AP002906.1-201ENST00000603405 233 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
R3HDM1Q15032 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
R3HDM1Q15032 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
R3HDM1Q15032 AC105402.3-203ENST00000608822 885 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
R3HDM1Q15032 AL671511.2-201ENST00000611838 659 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
R3HDM1Q15032 AC010975.3-201ENST00000618727 978 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
R3HDM1Q15032 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
R3HDM1Q15032 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
R3HDM1Q15032 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
R3HDM1Q15032 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
R3HDM1Q15032 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
R3HDM1Q15032 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.47
R3HDM1Q15032 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
R3HDM1Q15032 LINC02456-201ENST00000635615 1323 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
R3HDM1Q15032 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
R3HDM1Q15032 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
R3HDM1Q15032 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
R3HDM1Q15032 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
R3HDM1Q15032 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
R3HDM1Q15032 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
R3HDM1Q15032 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
R3HDM1Q15032 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
R3HDM1Q15032 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
R3HDM1Q15032 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
R3HDM1Q15032 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
R3HDM1Q15032 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
R3HDM1Q15032 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.9 ms