Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 5S_rRNA.28-201ENST00000638107 119 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
MTMR3Q13615 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
MTMR3Q13615 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
MTMR3Q13615 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
MTMR3Q13615 FASTKD2-201ENST00000236980 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
MTMR3Q13615 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
MTMR3Q13615 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
MTMR3Q13615 SELE-204ENST00000367776 3576 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
MTMR3Q13615 SELE-205ENST00000367777 3576 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
MTMR3Q13615 APBB2-230ENST00000543538 6992 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
MTMR3Q13615 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
MTMR3Q13615 LINC01722-201ENST00000456265 3033 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
MTMR3Q13615 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
MTMR3Q13615 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
MTMR3Q13615 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
MTMR3Q13615 AL358975.1-203ENST00000413352 2932 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
MTMR3Q13615 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
MTMR3Q13615 OXR1-201ENST00000297447 1944 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
MTMR3Q13615 LDAH-212ENST00000619656 3663 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
MTMR3Q13615 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
MTMR3Q13615 AL391361.1-201ENST00000405580 489 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
MTMR3Q13615 NUP35P2-201ENST00000416748 943 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
MTMR3Q13615 RPL7P57-201ENST00000423238 740 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
MTMR3Q13615 SETP9-201ENST00000423837 832 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
MTMR3Q13615 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
MTMR3Q13615 PPIAP10-201ENST00000438675 458 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
MTMR3Q13615 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
MTMR3Q13615 LINC01729-201ENST00000450640 358 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
MTMR3Q13615 RPL7AP10-201ENST00000481016 791 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
MTMR3Q13615 AC068672.3-203ENST00000505166 311 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
MTMR3Q13615 LINC02200-202ENST00000508879 615 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
MTMR3Q13615 AC010343.2-201ENST00000510162 224 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
MTMR3Q13615 AC010260.1-201ENST00000511484 664 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
MTMR3Q13615 AC113349.1-201ENST00000512105 583 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
MTMR3Q13615 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
MTMR3Q13615 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
MTMR3Q13615 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
MTMR3Q13615 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
MTMR3Q13615 KCTD21-AS1-206ENST00000532831 856 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
MTMR3Q13615 OLR1-210ENST00000544577 924 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
MTMR3Q13615 AL158058.1-201ENST00000549515 647 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
MTMR3Q13615 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
MTMR3Q13615 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
MTMR3Q13615 NPM1P42-201ENST00000560329 862 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
MTMR3Q13615 AC009145.2-201ENST00000562685 377 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
MTMR3Q13615 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
MTMR3Q13615 MIR3189-201ENST00000578735 73 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
MTMR3Q13615 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
MTMR3Q13615 LINC01198-207ENST00000598084 881 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
MTMR3Q13615 AC068790.5-201ENST00000602741 355 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
MTMR3Q13615 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
MTMR3Q13615 Metazoa_SRP.134-201ENST00000610965 327 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
MTMR3Q13615 RNA5SP440-201ENST00000612665 119 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
MTMR3Q13615 RN7SL787P-201ENST00000613000 284 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
MTMR3Q13615 MIR6719-201ENST00000622428 87 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
MTMR3Q13615 C1orf195-202ENST00000625027 441 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
MTMR3Q13615 OXSM-209ENST00000626005 309 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
MTMR3Q13615 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
MTMR3Q13615 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
MTMR3Q13615 ALG13-203ENST00000394780 4133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
MTMR3Q13615 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
MTMR3Q13615 AC008627.1-201ENST00000517511 1704 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
MTMR3Q13615 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
MTMR3Q13615 AC025470.1-201ENST00000510053 2032 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
MTMR3Q13615 GBP3-202ENST00000370481 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
MTMR3Q13615 PDCD1LG2-201ENST00000397747 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
MTMR3Q13615 LINC02086-202ENST00000492522 2091 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
MTMR3Q13615 ZNF177-202ENST00000589262 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
MTMR3Q13615 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
MTMR3Q13615 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
MTMR3Q13615 CUL3-216ENST00000617432 1426 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
MTMR3Q13615 LRRC37A3-204ENST00000400877 3273 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
MTMR3Q13615 PLET1-201ENST00000338832 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
MTMR3Q13615 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
MTMR3Q13615 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
MTMR3Q13615 C9orf153-202ENST00000376001 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
MTMR3Q13615 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
MTMR3Q13615 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
MTMR3Q13615 MIR105-2-201ENST00000385083 81 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
MTMR3Q13615 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
MTMR3Q13615 AL031674.1-202ENST00000413070 465 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
MTMR3Q13615 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
MTMR3Q13615 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
MTMR3Q13615 FAM230B-202ENST00000415704 396 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
MTMR3Q13615 AL158166.2-201ENST00000420845 748 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
MTMR3Q13615 TXNDC12-AS1-201ENST00000428794 391 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
MTMR3Q13615 AC007556.1-201ENST00000432133 307 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
MTMR3Q13615 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
MTMR3Q13615 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
MTMR3Q13615 GAPDHP14-201ENST00000450472 937 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
MTMR3Q13615 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
MTMR3Q13615 AL157371.1-201ENST00000451910 394 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
MTMR3Q13615 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
MTMR3Q13615 AL445665.1-202ENST00000452436 324 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
MTMR3Q13615 YWHAEP1-201ENST00000453697 763 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
MTMR3Q13615 RANP2-201ENST00000456833 229 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
MTMR3Q13615 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
MTMR3Q13615 OARD1-207ENST00000468811 819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
MTMR3Q13615 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
MTMR3Q13615 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.2 ms