Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 MFSD8-201ENST00000296468 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 AC107021.2-201ENST00000567714 2095 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 FCHSD2-205ENST00000409853 1867 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 EED-203ENST00000351625 1696 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 OR4A15-201ENST00000314706 1035 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 PLET1-201ENST00000338832 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 MIR323B-201ENST00000385269 82 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 RN7SKP222-201ENST00000410651 315 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 Z93019.1-201ENST00000416450 973 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 AC011752.1-203ENST00000417609 582 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 AL158154.1-201ENST00000427387 465 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 BX890604.2-201ENST00000427883 474 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 NPM1P34-201ENST00000428821 893 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 AL162726.1-201ENST00000436084 455 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 RN7SL51P-201ENST00000468230 285 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 EPDR1-204ENST00000476620 555 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 PTPN20-212ENST00000502254 599 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 KCTD9P2-201ENST00000512203 1013 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 AC009623.1-201ENST00000517964 1131 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 GABARAPL1-212ENST00000543602 653 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 AC106745.1-201ENST00000566798 464 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 TTN-AS1-237ENST00000590743 812 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 SUGT1P3-202ENST00000604259 383 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 LINC00850-201ENST00000629221 685 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 AC087667.1-201ENST00000500180 1422 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 RNF6P1-201ENST00000444889 1784 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 DLGAP1-AS2-202ENST00000573177 1388 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 ALG11-202ENST00000521508 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 RYR3-202ENST00000415757 15557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 FIRRE-202ENST00000637577 1635 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 MAST4-207ENST00000407621 559 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 VN1R8P-201ENST00000407739 893 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 SPRYD7P1-201ENST00000443861 570 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 NF1P3-201ENST00000457709 450 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 AC096554.1-201ENST00000458182 529 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 RPL15P21-201ENST00000495592 567 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 AC108693.1-201ENST00000496068 432 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 AC079226.2-201ENST00000509283 518 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 ATP5LP3-201ENST00000514223 304 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 AL390334.1-201ENST00000556395 450 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 MIR3176-201ENST00000582210 90 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 AC093388.1-201ENST00000609166 430 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 ATE1-AS1-202ENST00000636460 506 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 AC092017.3-201ENST00000638880 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 AC079776.5-201ENST00000641920 211 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
AP3B2Q13367 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.5 ms