Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 OSBPL9P2-201ENST00000526582 1228 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AC007424.1-203ENST00000554613 687 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AC142086.4-201ENST00000568904 650 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 MIR3691-201ENST00000578066 90 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AC138035.1-202ENST00000604669 683 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AC010680.4-201ENST00000605334 543 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 GPN1-205ENST00000458167 1618 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 FIRRE-202ENST00000637577 1635 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 NSD3-206ENST00000527502 4471 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 SOAT1-201ENST00000367619 6835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 TRIM51-201ENST00000244891 1329 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 SULT1E1-201ENST00000226444 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 EPB41L2-220ENST00000528282 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AJ009632.2-208ENST00000635525 4123 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 CLCC1-204ENST00000369968 4151 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 DCX-207ENST00000635795 9163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 SORBS1-205ENST00000371227 7279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 LINC01378-201ENST00000422145 2516 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 CEP152-201ENST00000325747 4986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 TMEM225-201ENST00000375026 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 RN7SKP125-201ENST00000410481 302 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 RPL26P37-201ENST00000411983 438 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AC098592.2-201ENST00000413158 265 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 FCF1P2-201ENST00000415284 583 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 LINC01074-201ENST00000422527 555 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AL137005.1-201ENST00000452944 719 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AC002075.1-201ENST00000457396 676 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AC058823.1-201ENST00000485315 474 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 LINC00589-202ENST00000518623 938 ntTSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AC008415.1-201ENST00000522189 734 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AC020659.1-204ENST00000562920 400 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AC006116.10-201ENST00000591836 581 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AC010200.2-201ENST00000605098 235 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AC133644.2-201ENST00000608142 540 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AC015922.4-201ENST00000612568 690 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AL137078.2-201ENST00000615740 318 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 DMD-211ENST00000378707 7410 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 IPCEF1-210ENST00000519344 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 C16orf87-202ENST00000394806 6640 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AMY1B-201ENST00000330330 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 CASC15-206ENST00000606851 1889 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 RPGRIP1-201ENST00000382933 2004 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 HSPA8P18-201ENST00000439846 1928 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 BRCA1-210ENST00000471181 5936 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 MARCH7-201ENST00000259050 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 TTC39B-207ENST00000507993 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 NOL4-203ENST00000538587 1979 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 DOCK4-AS1-201ENST00000452714 2494 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 POSTN-204ENST00000379749 3210 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 ZCCHC6-201ENST00000277141 5724 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AC012078.1-201ENST00000405035 1646 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 PTPRZ1-202ENST00000449182 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 GTF2H1-204ENST00000524753 1510 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 DCN-218ENST00000551354 2924 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 NSF-206ENST00000575068 2667 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 IL6-206ENST00000407492 926 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AC017078.1-201ENST00000416146 368 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
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