Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 AC012146.1-201ENST00000571138 462 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 AL132656.2-201ENST00000482985 1837 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 ETV1-202ENST00000399357 6096 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 UBE3AP2-201ENST00000429033 2259 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 AL691447.1-201ENST00000419456 387 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 EIF4EP1-201ENST00000422311 642 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 SEPT7P3-201ENST00000455017 621 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 AC037198.2-201ENST00000478845 733 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 FTH1P24-201ENST00000503502 462 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 TBCA-206ENST00000518338 551 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 OR5M1-201ENST00000526538 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 AC073864.1-201ENST00000540161 562 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 AC091231.1-201ENST00000558443 391 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 AC097372.3-201ENST00000503593 522 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 OR10D4P-201ENST00000525892 951 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 LINC02131-201ENST00000563289 419 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 AC119674.1-212ENST00000641155 993 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 MLF1-208ENST00000478894 1372 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 AL138749.1-201ENST00000397864 791 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 AC090505.2-201ENST00000427064 464 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 AC069285.2-201ENST00000440210 275 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 CREM-228ENST00000473940 1182 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 RFPL4AP5-201ENST00000514977 504 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 AP003472.2-201ENST00000523554 639 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 AP006287.2-201ENST00000529036 502 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 MAPK10-253ENST00000641010 4072 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 OR10D3-202ENST00000641351 3561 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 AC034195.1-201ENST00000420000 559 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 AC021035.1-201ENST00000421597 427 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 HIGD1AP12-201ENST00000427832 281 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 AC026353.1-201ENST00000470523 558 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 UBA52P3-201ENST00000491303 382 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 AC080014.1-201ENST00000496877 1201 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 AC023161.2-201ENST00000551218 780 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 AL163642.2-201ENST00000604722 1019 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 AC124312.4-201ENST00000605533 310 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 MNDA-201ENST00000368141 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 LINC00862-204ENST00000637098 1400 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 AL445213.1-201ENST00000412589 747 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 SDCBPP2-201ENST00000424643 885 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 AC012070.1-201ENST00000442062 427 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 THUMPD3-AS1-210ENST00000519043 1115 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 LINC02565-201ENST00000592678 478 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 AC097467.3-207ENST00000602249 725 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 FBXO8-205ENST00000615392 1591 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 OR4F6-201ENST00000328882 1238 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 ANKRD36P1-201ENST00000344424 659 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPRGP23470 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.6 ms