Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
CCL3L1P16619 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
CCL3L1P16619 FOXP2-205ENST00000393489 2285 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
CCL3L1P16619 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
CCL3L1P16619 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
CCL3L1P16619 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
CCL3L1P16619 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
CCL3L1P16619 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCL3L1P16619 OR52B1P-201ENST00000316506 909 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCL3L1P16619 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCL3L1P16619 PLCE1-AS2-201ENST00000419353 459 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CCL3L1P16619 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CCL3L1P16619 UTS2B-203ENST00000427544 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
CCL3L1P16619 ARL4AP4-201ENST00000434170 518 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCL3L1P16619 C4orf26-202ENST00000435974 560 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CCL3L1P16619 LINC00411-201ENST00000436722 461 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CCL3L1P16619 LINC01773-201ENST00000437598 787 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CCL3L1P16619 LINC02096-201ENST00000445035 953 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CCL3L1P16619 RPL23AP73-201ENST00000492507 471 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCL3L1P16619 IL7R-204ENST00000506850 1004 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CCL3L1P16619 AC005699.1-201ENST00000510095 555 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CCL3L1P16619 EGFLAM-AS2-201ENST00000512603 466 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CCL3L1P16619 EGFLAM-AS2-202ENST00000514377 539 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CCL3L1P16619 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCL3L1P16619 SNORA70.17-201ENST00000516449 133 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCL3L1P16619 AF186190.1-201ENST00000517470 480 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCL3L1P16619 AC018442.3-201ENST00000523025 183 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCL3L1P16619 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCL3L1P16619 DEFB109D-201ENST00000529497 240 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCL3L1P16619 AC089983.1-201ENST00000549807 701 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CCL3L1P16619 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CCL3L1P16619 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCL3L1P16619 MESTIT1_2.1-201ENST00000616328 235 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCL3L1P16619 RMST_9.1-201ENST00000619945 193 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCL3L1P16619 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCL3L1P16619 AC244205.2-202ENST00000635781 342 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCL3L1P16619 IQCH-214ENST00000629425 1822 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
CCL3L1P16619 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
CCL3L1P16619 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CCL3L1P16619 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CCL3L1P16619 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
CCL3L1P16619 AC233968.1-201ENST00000611212 1300 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCL3L1P16619 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CCL3L1P16619 TLR8-202ENST00000311912 3367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CCL3L1P16619 ZNF568-214ENST00000616085 3542 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CCL3L1P16619 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CCL3L1P16619 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CCL3L1P16619 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CCL3L1P16619 STX19-201ENST00000315099 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CCL3L1P16619 TCEAL7-201ENST00000332431 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CCL3L1P16619 SLC30A7-201ENST00000357650 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CCL3L1P16619 GCNT6-201ENST00000379591 934 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCL3L1P16619 DDX18P3-201ENST00000404856 2007 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCL3L1P16619 RN7SKP177-201ENST00000410567 355 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCL3L1P16619 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CCL3L1P16619 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCL3L1P16619 AC097717.1-228ENST00000417006 754 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CCL3L1P16619 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CCL3L1P16619 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCL3L1P16619 TTC3-AS1-201ENST00000424733 1097 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CCL3L1P16619 LINC00266-4P-201ENST00000427373 842 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CCL3L1P16619 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CCL3L1P16619 C21orf91-OT1-202ENST00000430815 717 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CCL3L1P16619 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCL3L1P16619 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCL3L1P16619 AC239367.2-201ENST00000447309 705 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCL3L1P16619 AC239798.3-201ENST00000454459 408 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCL3L1P16619 AC091564.1-201ENST00000464563 479 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCL3L1P16619 AC023598.1-201ENST00000472521 361 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
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CCL3L1P16619 TFEC-208ENST00000484212 1245 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CCL3L1P16619 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CCL3L1P16619 AC008728.1-201ENST00000512730 691 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CCL3L1P16619 MIR2114-201ENST00000516645 80 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCL3L1P16619 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCL3L1P16619 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CCL3L1P16619 CLEC7A-212ENST00000533022 625 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CCL3L1P16619 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CCL3L1P16619 AC005911.1-201ENST00000619883 456 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CCL3L1P16619 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCL3L1P16619 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCL3L1P16619 AC067931.1-201ENST00000624190 671 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCL3L1P16619 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CCL3L1P16619 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CCL3L1P16619 PNPLA8-204ENST00000426128 4268 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CCL3L1P16619 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CCL3L1P16619 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCL3L1P16619 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CCL3L1P16619 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CCL3L1P16619 IL1R1-204ENST00000409929 1858 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CCL3L1P16619 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CCL3L1P16619 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CCL3L1P16619 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CCL3L1P16619 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCL3L1P16619 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CCL3L1P16619 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CCL3L1P16619 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCL3L1P16619 TAS2R19-201ENST00000390673 1002 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CCL3L1P16619 AL138749.1-201ENST00000397864 791 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CCL3L1P16619 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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