Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 AC129492.2-201ENST00000577807 517 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 CEACAM7-204ENST00000602225 524 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 CR589904.2-201ENST00000612533 440 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 AC016957.2-201ENST00000616998 848 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 AL591424.2-201ENST00000617023 128 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 AL445567.2-201ENST00000618935 498 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 AC005858.1-201ENST00000620193 677 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 MIR325HG-208ENST00000630388 1043 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 AC244205.2-202ENST00000635781 342 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 AL138828.1-203ENST00000419926 1570 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 DAZ4-206ENST00000449750 3271 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 AC017002.4-201ENST00000604721 1525 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 LINC01197-202ENST00000555332 3568 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 HGF-202ENST00000354224 1425 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 NPSR1-AS1-205ENST00000436945 1406 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 NLGN1-201ENST00000361589 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 AC005261.4-201ENST00000600047 1385 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 ZFYVE16-201ENST00000338008 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 RPS4XP5-202ENST00000449995 1334 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 OR5K4-201ENST00000354924 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 RNU6-304P-201ENST00000364855 107 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 PMS1-202ENST00000374826 948 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 AL929288.1-201ENST00000426262 746 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 DPY19L1P2-201ENST00000426647 915 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 MTND4LP7-201ENST00000431728 294 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 AC023128.1-201ENST00000432431 799 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 LPP-AS1-201ENST00000434996 494 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 AL451129.1-201ENST00000437471 285 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 MTCO3P43-201ENST00000440974 771 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 MLIP-IT1-201ENST00000441845 643 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 AC104781.1-201ENST00000449838 397 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 LINC01941-201ENST00000455174 624 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 AL645608.2-201ENST00000458555 471 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 RPL7P19-201ENST00000469948 618 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 AC105137.1-201ENST00000484355 562 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 AF213884.1-201ENST00000488102 463 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 AC091167.1-201ENST00000492017 396 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 AC092994.1-201ENST00000498604 279 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 AC113404.3-201ENST00000506621 555 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 COMMD10-206ENST00000515539 869 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 LINC00500-201ENST00000515860 539 ntTSL 4 BASIC3.79□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 AC084768.1-201ENST00000518926 923 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 AP003472.1-201ENST00000519844 644 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 CASP1-216ENST00000534497 825 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 AC019209.2-201ENST00000545704 373 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 AC079328.3-201ENST00000558905 691 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 C15orf41-203ENST00000562489 715 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 AL133457.1-201ENST00000564251 987 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 AC068408.2-201ENST00000584566 439 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 LINC00347-205ENST00000597518 868 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 AL161729.3-201ENST00000603533 673 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 AC114878.2-201ENST00000604863 1251 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 AL451044.1-201ENST00000604867 238 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 AC242628.1-201ENST00000606810 391 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 AC090948.2-201ENST00000607363 564 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 AL021368.1-201ENST00000607490 540 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 UBE2NL-201ENST00000618570 1185 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 KCNRG-202ENST00000360473 1623 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 C1orf112-203ENST00000413811 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 IL23R-202ENST00000395227 1459 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 CD86-203ENST00000393627 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 CR381670.1-201ENST00000624291 1693 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 AC092079.1-201ENST00000558620 1985 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 AC008725.1-201ENST00000605123 2263 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 ETV1-202ENST00000399357 6096 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 AC021355.1-202ENST00000519996 1633 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 OR11H5P-202ENST00000641612 1325 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 AL158212.2-201ENST00000369391 460 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 MFAP5-202ENST00000396549 1195 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 Z86062.1-201ENST00000406773 777 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 AL603766.1-201ENST00000407763 664 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 RN7SKP182-201ENST00000410772 298 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 RANP4-201ENST00000413361 655 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 AC097467.3-223ENST00000417474 449 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 AL691517.1-201ENST00000440833 1235 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 AC092809.1-201ENST00000441469 474 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 LINC01307-202ENST00000444327 771 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 AL162388.1-201ENST00000450912 352 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 SNAP25-AS1-204ENST00000451151 867 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 RBBP6-204ENST00000452655 854 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 LINC00971-203ENST00000491849 452 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
NRF1Q16656 MTCO1P31-201ENST00000506355 492 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.3 ms