Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 AL034403.1-201ENST00000399414 885 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 BTF3P9-201ENST00000418784 283 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 AC092647.1-201ENST00000420654 287 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 AC093581.1-202ENST00000430890 391 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 MTCYBP29-201ENST00000436327 1006 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 AL158053.1-201ENST00000441503 453 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 LINC00412-201ENST00000444744 420 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 CREM-220ENST00000463314 964 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 CAB39P1-201ENST00000502277 460 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 LINC01612-201ENST00000504509 469 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 STPG2-AS1-201ENST00000508933 537 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 SNORA76.2-201ENST00000517095 137 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 THUMPD3-AS1-210ENST00000519043 1115 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 AC099520.1-205ENST00000524083 316 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 AC073862.1-201ENST00000537998 409 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 AC140847.1-201ENST00000538025 534 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 AC073651.3-201ENST00000545999 417 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 LINC01479-202ENST00000546170 444 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 AC078880.1-201ENST00000546696 553 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 AC084398.2-201ENST00000551918 564 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 SNHG14-221ENST00000554726 1116 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 AC079148.1-201ENST00000565944 819 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 AC100844.1-201ENST00000580622 440 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 AC015911.5-201ENST00000587076 451 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 AL391497.1-201ENST00000608671 547 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 AC005911.1-201ENST00000619883 456 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 AL139089.1-201ENST00000620372 975 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 AC097460.3-201ENST00000623099 442 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 RPL23AP61-201ENST00000623642 466 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 SATB1-AS1-237ENST00000626982 735 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 SPAM1-201ENST00000223028 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 ANKRD30A-201ENST00000361713 4405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 ZNF679-202ENST00000421025 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 ADGRL2-208ENST00000370725 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 SPATA31D2P-201ENST00000429999 4388 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 ANKRD30A-204ENST00000602533 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 AL136520.1-201ENST00000600311 1322 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 DNAH14-203ENST00000366848 929 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 OR5K3-201ENST00000383695 966 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 RNU6-31P-201ENST00000384388 108 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 ZNF602P-201ENST00000405929 924 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 AL355143.1-201ENST00000407101 841 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 RPS3AP25-201ENST00000411660 793 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 LINC01423-201ENST00000414189 608 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 MTND2P15-201ENST00000418575 892 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 MTND4LP13-201ENST00000425022 298 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 ARL4AP3-201ENST00000441452 574 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 GXYLT1P1-201ENST00000446657 490 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 PRR16-203ENST00000446965 1152 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 AC107072.2-201ENST00000452412 555 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 AL450344.2-201ENST00000455229 614 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 AC008592.2-201ENST00000506070 571 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 AC113430.1-201ENST00000506872 718 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 AC114284.1-201ENST00000511422 1114 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 VTA1P2-201ENST00000520205 911 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 AP003102.1-201ENST00000525638 661 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 TSPAN19-204ENST00000532498 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 AC018767.1-201ENST00000566236 405 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 AC079171.1-201ENST00000568788 914 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 LINC02520-201ENST00000570443 537 ntTSL 4 BASIC4.04□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 AC005899.4-201ENST00000581915 514 ntTSL 4 BASIC4.04□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC4.04□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 AC133552.5-201ENST00000604266 540 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 AC015849.2-201ENST00000605738 409 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 AL096803.3-201ENST00000609032 532 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 AC095038.2-201ENST00000621464 1070 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 AC067931.1-201ENST00000624190 671 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 BANCR-201ENST00000624238 473 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 C8orf89-203ENST00000625134 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 AC084816.1-212ENST00000625240 1114 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 ATL2-217ENST00000629272 1242 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 SATB1-AS1-263ENST00000630022 622 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 AC105074.1-201ENST00000623380 3095 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 AC107021.2-201ENST00000567714 2095 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 VNN3-211ENST00000509351 1700 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 DNAH8-205ENST00000449981 12940 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 PLCB4-206ENST00000414679 3947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
RUNX3Q13761 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.6 ms