Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 SLAIN2-205ENST00000512093 4219 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 SPANXN3-201ENST00000370503 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 RNU6-354P-201ENST00000383862 107 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 RNU6-610P-201ENST00000384264 107 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 OR6C69P-201ENST00000394268 893 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 OTUD6B-202ENST00000404789 1089 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 RBMS3-AS1-201ENST00000414547 554 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 AC104389.1-201ENST00000418080 522 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 AL513128.1-201ENST00000422675 469 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 AC234779.1-201ENST00000425910 285 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 AC007403.1-201ENST00000427579 567 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 YWHAEP5-201ENST00000431545 765 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 AC006037.1-201ENST00000437967 287 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 AC009263.1-201ENST00000441193 1239 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 AL691497.1-201ENST00000443270 449 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 RPS26P30-201ENST00000443431 335 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 LINC02527-201ENST00000449069 762 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 RBBP6-204ENST00000452655 854 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 DNAJC19P8-201ENST00000452887 259 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 MRPL35P4-201ENST00000453682 566 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 AL138737.1-201ENST00000456896 1252 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 AC096992.1-201ENST00000459808 709 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 AC010618.1-201ENST00000469924 477 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 RPL23AP2-201ENST00000471227 466 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 AC104689.1-201ENST00000473356 768 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 AC016598.2-201ENST00000514942 525 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 OR5BC1P-201ENST00000529327 739 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 LINC01495-201ENST00000532380 421 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 AP001360.2-201ENST00000534423 562 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 AL136298.1-201ENST00000557371 566 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 AC138907.2-201ENST00000561479 866 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 AC145350.4-201ENST00000562827 866 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 AC133485.5-201ENST00000563407 866 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 AC090079.2-201ENST00000575289 768 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 AC011477.5-201ENST00000586571 259 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 PDZPH1P-202ENST00000602846 722 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 AC025946.2-201ENST00000603398 234 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 AC023509.5-201ENST00000617434 807 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 AC007546.2-201ENST00000623996 360 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 RBMS3-AS3-202ENST00000635847 738 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 CCNYL2-202ENST00000637719 3311 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 ECT2-204ENST00000392692 4158 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 VIP-202ENST00000367244 1584 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 AC017104.4-201ENST00000636283 1592 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 AC007529.1-201ENST00000418574 2178 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 CNTD1-205ENST00000588527 1308 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 CFAP97-201ENST00000296775 903 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 OR5K1-201ENST00000332650 1097 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 RNU6-1339P-201ENST00000363574 91 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
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PRPF4BQ13523 AL132765.1-201ENST00000434165 553 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
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PRPF4BQ13523 LINC01802-201ENST00000438824 523 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 AL355601.1-201ENST00000444701 427 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
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PRPF4BQ13523 AC097478.1-202ENST00000508021 567 ntTSL 4 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 NSMCE2-206ENST00000519010 848 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 ZFAND1-208ENST00000519523 698 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 IGLVIV-53-201ENST00000520107 367 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 AC138701.1-201ENST00000524329 714 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
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PRPF4BQ13523 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
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PRPF4BQ13523 AC026992.1-202ENST00000558454 421 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 AC095057.3-201ENST00000567102 1157 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 LINC01791-201ENST00000589511 677 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 IPO5P1-202ENST00000600039 287 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 EIF1P6-201ENST00000600054 334 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 AL590392.1-201ENST00000604960 446 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 ARF4P1-201ENST00000605447 541 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
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