Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 AC095050.2-201ENST00000510748 1458 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 ECM2-202ENST00000375540 1606 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 HSPD1P14-201ENST00000432666 1618 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 FCHSD2-205ENST00000409853 1867 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 MIR620-201ENST00000385232 95 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 PRELID3BP11-201ENST00000414230 479 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 EIF1P3-201ENST00000423841 334 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 AC012519.1-201ENST00000424588 610 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 MTCO1P43-201ENST00000431831 488 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 Z93403.1-202ENST00000440002 713 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 AL162419.1-201ENST00000440674 873 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 AL512326.1-201ENST00000443050 721 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 TAB3-AS2-201ENST00000445240 292 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 AGBL4-IT1-201ENST00000457061 514 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 AC112206.1-201ENST00000468416 477 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 RPL21P18-201ENST00000469899 480 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 FAM104B-204ENST00000472571 1109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 SETP6-201ENST00000479329 568 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 RPL23AP37-201ENST00000479658 549 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 AC104687.1-201ENST00000485829 412 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 AC096576.3-201ENST00000505528 721 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 LINC01088-203ENST00000507476 785 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 MTCO1P35-201ENST00000515270 228 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 RNU5A-7P-201ENST00000515979 116 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 AC136424.2-201ENST00000522582 563 ntTSL 4 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 OR5BC1P-201ENST00000529327 739 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 CD69-203ENST00000536709 1020 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 AL445363.1-202ENST00000553697 545 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 AC016134.1-201ENST00000565259 701 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 AC106734.1-201ENST00000568646 663 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 RN7SL176P-201ENST00000580352 264 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 AC068620.3-201ENST00000602749 560 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 AC090181.2-201ENST00000602975 672 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 AC020910.2-201ENST00000603635 610 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 AL392112.1-201ENST00000605115 829 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 AP003117.2-201ENST00000606010 545 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
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SGCGQ13326 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 AL391834.2-201ENST00000609982 546 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 PRKCQ-AS1-213ENST00000613985 883 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
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SGCGQ13326 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 AL356118.1-201ENST00000635272 1078 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 AC092813.1-201ENST00000635455 969 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
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SGCGQ13326 AC104662.3-202ENST00000507794 4055 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 NFIB-211ENST00000606230 2311 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 AC026523.1-202ENST00000559363 1401 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
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SGCGQ13326 KLHL13-208ENST00000541812 3102 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 BCAP29-203ENST00000379119 5773 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
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SGCGQ13326 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 AC087190.4-201ENST00000574616 8334 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 RNU6-354P-201ENST00000383862 107 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 RNU6-610P-201ENST00000384264 107 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 HNRNPDP2-201ENST00000406475 478 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 AC234782.4-201ENST00000417646 1048 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 LINC02542-201ENST00000418567 822 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 AL139095.3-201ENST00000419672 1203 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 AL353801.1-201ENST00000425541 425 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 NPM1P34-201ENST00000428821 893 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 RPS27AP12-201ENST00000429552 465 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 AC239803.1-202ENST00000432038 590 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 AC136489.1-201ENST00000438181 717 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 LINC00366-201ENST00000441430 435 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 AL355601.1-201ENST00000444701 427 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 FGF7P3-201ENST00000454645 303 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 AL645608.2-201ENST00000458555 471 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
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