Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 AC069437.1-201ENST00000551372 512 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
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TRAF1Q13077 RFESD-208ENST00000513950 464 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
TRAF1Q13077 AC120193.1-201ENST00000518988 741 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
TRAF1Q13077 HAUS1P3-201ENST00000523909 662 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TRAF1Q13077 UBTFL10-201ENST00000528532 562 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
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