Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

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Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 ZNF28-203ENST00000438150 5171 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 REREP1Y-201ENST00000422655 198 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 UTS2B-203ENST00000427544 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 REREP2Y-201ENST00000439103 200 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 UBA52P3-201ENST00000491303 382 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 AC018752.1-201ENST00000507813 206 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 AC011473.1-201ENST00000601280 443 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 MRPS35P3-201ENST00000603189 709 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 AC233309.1-201ENST00000619522 751 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 C2orf16-201ENST00000408964 6200 ntAPPRIS P2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 EMSY-201ENST00000334736 5508 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 ZNF736P2Y-201ENST00000416040 1279 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 LINC00266-4P-201ENST00000427373 842 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 OR52Y1P-201ENST00000452418 828 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 APOC2-203ENST00000590360 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 AC020914.6-201ENST00000594327 272 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 AC125494.3-201ENST00000602759 455 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 AL162591.3-201ENST00000607963 681 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 SCN2A-215ENST00000637266 8610 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 AL590867.1-201ENST00000392385 1212 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 KATNBL1P2-201ENST00000433311 835 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 AC013762.1-201ENST00000531136 467 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 FAXC-204ENST00000538471 941 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 AC244258.1-201ENST00000637553 1071 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 PHLDB2-211ENST00000481953 5474 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 OTUD4P1-201ENST00000237841 3067 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 FAR2-203ENST00000547116 1787 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 AL451127.1-201ENST00000422909 624 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 OR5AW1P-201ENST00000426334 1006 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 HIGD1AP4-201ENST00000430194 280 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 AC108062.1-201ENST00000505133 637 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 AC019133.1-201ENST00000508292 420 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 LRRC37A5P-202ENST00000536054 1095 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 OR5A1-202ENST00000641045 8612 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 OR4K13-201ENST00000315693 915 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 ZNF602P-201ENST00000405929 924 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 AL160191.1-201ENST00000555480 566 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 CSNK1G3-205ENST00000510842 1979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 KLRC1-201ENST00000347831 1332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 ALG14-201ENST00000370205 9367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 PDCD1LG2-201ENST00000397747 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 ARV1-202ENST00000366658 1170 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 TAF9BP1-201ENST00000396646 746 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 AC002454.1-204ENST00000419668 527 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 LINC00977-201ENST00000509893 1163 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 CT45A3-201ENST00000597510 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 AL590235.2-201ENST00000602641 632 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 CT45A2-201ENST00000605791 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 AL391497.1-201ENST00000608671 547 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 AC243654.2-201ENST00000612843 443 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 OR4K13-203ENST00000641904 5684 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 AC090510.1-202ENST00000500850 2017 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 NACAP7-201ENST00000407371 609 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 SETP9-201ENST00000423837 832 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
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