Protein–RNA interactions for Protein: P51787

KCNQ1, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 1, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1P51787 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KCNQ1P51787 OR4A43P-201ENST00000532938 908 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
KCNQ1P51787 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KCNQ1P51787 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KCNQ1P51787 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KCNQ1P51787 LINC02293-202ENST00000548385 358 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KCNQ1P51787 LINC02444-201ENST00000550723 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
KCNQ1P51787 RNASE9-206ENST00000554964 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
KCNQ1P51787 AC109462.2-201ENST00000558730 763 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KCNQ1P51787 OR4G1P-201ENST00000588632 938 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
KCNQ1P51787 VN1R92P-201ENST00000598511 928 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
KCNQ1P51787 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
KCNQ1P51787 AL391358.1-201ENST00000605342 190 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
KCNQ1P51787 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
KCNQ1P51787 AC241377.1-201ENST00000619797 406 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
KCNQ1P51787 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
KCNQ1P51787 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KCNQ1P51787 AF067845.5-201ENST00000633906 437 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KCNQ1P51787 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
KCNQ1P51787 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
KCNQ1P51787 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
KCNQ1P51787 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
KCNQ1P51787 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KCNQ1P51787 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
KCNQ1P51787 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KCNQ1P51787 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
KCNQ1P51787 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KCNQ1P51787 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KCNQ1P51787 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KCNQ1P51787 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KCNQ1P51787 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KCNQ1P51787 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KCNQ1P51787 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KCNQ1P51787 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KCNQ1P51787 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KCNQ1P51787 U3.22-201ENST00000391120 215 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KCNQ1P51787 MTCO3P31-201ENST00000405526 789 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KCNQ1P51787 OR2A25-201ENST00000408898 1014 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KCNQ1P51787 RPS7P13-201ENST00000413955 498 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KCNQ1P51787 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KCNQ1P51787 AL672277.1-201ENST00000420865 588 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KCNQ1P51787 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KCNQ1P51787 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KCNQ1P51787 ARL6IP1P2-201ENST00000431356 563 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KCNQ1P51787 TEX41-206ENST00000432608 661 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KCNQ1P51787 AL136140.1-201ENST00000436113 473 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KCNQ1P51787 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KCNQ1P51787 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KCNQ1P51787 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KCNQ1P51787 AC022034.3-201ENST00000471393 478 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KCNQ1P51787 AC113347.4-201ENST00000506032 685 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KCNQ1P51787 AC090071.1-201ENST00000507713 644 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KCNQ1P51787 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KCNQ1P51787 RN7SKP92-201ENST00000517266 244 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KCNQ1P51787 MAL2-201ENST00000522112 573 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KCNQ1P51787 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KCNQ1P51787 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KCNQ1P51787 SNHG1-217ENST00000541578 588 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KCNQ1P51787 AC117505.1-202ENST00000547027 566 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KCNQ1P51787 MIR4307HG-201ENST00000548170 822 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KCNQ1P51787 AL162872.1-201ENST00000557709 448 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KCNQ1P51787 AGBL1-AS1-203ENST00000566878 865 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KCNQ1P51787 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KCNQ1P51787 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KCNQ1P51787 AC009120.7-201ENST00000623452 780 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KCNQ1P51787 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KCNQ1P51787 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KCNQ1P51787 ITGA9-AS1-218ENST00000630762 751 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KCNQ1P51787 AC134980.1-203ENST00000640541 570 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KCNQ1P51787 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KCNQ1P51787 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KCNQ1P51787 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KCNQ1P51787 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KCNQ1P51787 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KCNQ1P51787 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KCNQ1P51787 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KCNQ1P51787 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KCNQ1P51787 BNIP2-202ENST00000415213 1509 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KCNQ1P51787 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KCNQ1P51787 AC016745.2-201ENST00000608834 3443 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KCNQ1P51787 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
KCNQ1P51787 ARHGAP42P1-201ENST00000507474 1976 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
KCNQ1P51787 AC104118.1-201ENST00000607625 1589 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
KCNQ1P51787 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
KCNQ1P51787 HTR1F-201ENST00000319595 3140 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
KCNQ1P51787 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
KCNQ1P51787 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
KCNQ1P51787 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
KCNQ1P51787 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
KCNQ1P51787 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
KCNQ1P51787 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
KCNQ1P51787 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
KCNQ1P51787 LINC00474-201ENST00000374014 769 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
KCNQ1P51787 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
KCNQ1P51787 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
KCNQ1P51787 AL353608.1-201ENST00000419576 416 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
KCNQ1P51787 HNRNPA1P29-201ENST00000426409 879 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
KCNQ1P51787 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
KCNQ1P51787 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
KCNQ1P51787 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms