Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 SNHG1-217ENST00000541578 588 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
LINC00587B1AMM8 AC068768.1-204ENST00000544890 796 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
LINC00587B1AMM8 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
LINC00587B1AMM8 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
LINC00587B1AMM8 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LINC00587B1AMM8 MIR7515HG-226ENST00000588330 1055 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
LINC00587B1AMM8 AC004477.3-201ENST00000614061 590 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LINC00587B1AMM8 MIR6737-201ENST00000617385 70 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LINC00587B1AMM8 AC112694.2-201ENST00000623697 768 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LINC00587B1AMM8 AC107398.4-201ENST00000635489 765 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
LINC00587B1AMM8 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
LINC00587B1AMM8 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
LINC00587B1AMM8 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
LINC00587B1AMM8 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
LINC00587B1AMM8 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LINC00587B1AMM8 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
LINC00587B1AMM8 PIGN-240ENST00000639912 6530 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LINC00587B1AMM8 OR5K1-201ENST00000332650 1097 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LINC00587B1AMM8 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LINC00587B1AMM8 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LINC00587B1AMM8 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
LINC00587B1AMM8 SNORA17A-201ENST00000391185 133 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LINC00587B1AMM8 AL034374.1-201ENST00000406329 351 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LINC00587B1AMM8 PPP3R1-203ENST00000409752 851 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LINC00587B1AMM8 AL603962.1-201ENST00000413148 436 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LINC00587B1AMM8 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LINC00587B1AMM8 FAR1P1-201ENST00000427163 934 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LINC00587B1AMM8 LIX1L-AS1-205ENST00000437797 536 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LINC00587B1AMM8 AL121974.1-201ENST00000437859 377 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LINC00587B1AMM8 AC074327.1-201ENST00000448017 540 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LINC00587B1AMM8 AURKAPS1-201ENST00000451805 1212 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LINC00587B1AMM8 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LINC00587B1AMM8 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LINC00587B1AMM8 AC023141.9-201ENST00000458734 412 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LINC00587B1AMM8 AC090114.3-201ENST00000479267 829 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LINC00587B1AMM8 AC072052.1-201ENST00000496556 306 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LINC00587B1AMM8 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LINC00587B1AMM8 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LINC00587B1AMM8 AC094108.1-201ENST00000502494 527 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LINC00587B1AMM8 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LINC00587B1AMM8 CXCL11-202ENST00000503860 767 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LINC00587B1AMM8 ZCCHC10-203ENST00000504170 325 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
LINC00587B1AMM8 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
LINC00587B1AMM8 PTGES3P3-201ENST00000511479 482 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LINC00587B1AMM8 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LINC00587B1AMM8 AC090993.1-201ENST00000522460 582 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LINC00587B1AMM8 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LINC00587B1AMM8 AP002765.2-201ENST00000532961 666 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LINC00587B1AMM8 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LINC00587B1AMM8 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
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LINC00587B1AMM8 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
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LINC00587B1AMM8 AC025175.1-201ENST00000606482 759 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LINC00587B1AMM8 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LINC00587B1AMM8 AC016957.2-201ENST00000616998 848 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LINC00587B1AMM8 TADA2A-212ENST00000620367 1043 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
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LINC00587B1AMM8 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
LINC00587B1AMM8 CIR1P2-201ENST00000514821 1342 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LINC00587B1AMM8 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LINC00587B1AMM8 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LINC00587B1AMM8 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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LINC00587B1AMM8 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
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LINC00587B1AMM8 DPRX-201ENST00000376650 648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
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LINC00587B1AMM8 AF178030.1-201ENST00000415088 402 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
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LINC00587B1AMM8 AL136084.2-202ENST00000433997 353 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
LINC00587B1AMM8 LINC01754-201ENST00000437920 750 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
LINC00587B1AMM8 TRIM31-AS1-204ENST00000440874 549 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
LINC00587B1AMM8 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LINC00587B1AMM8 CCRL1P1-201ENST00000449542 1053 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LINC00587B1AMM8 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
LINC00587B1AMM8 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LINC00587B1AMM8 LINC01767-201ENST00000451914 545 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
LINC00587B1AMM8 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LINC00587B1AMM8 AC006511.1-201ENST00000470614 315 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LINC00587B1AMM8 NPM1P17-201ENST00000479221 602 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LINC00587B1AMM8 AC068724.1-201ENST00000487100 792 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LINC00587B1AMM8 RPL37P23-201ENST00000492641 294 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LINC00587B1AMM8 ATP1B1P1-201ENST00000509767 915 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LINC00587B1AMM8 MTATP6P1-201ENST00000514057 681 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LINC00587B1AMM8 RNA5SP473-201ENST00000516402 125 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LINC00587B1AMM8 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LINC00587B1AMM8 TRAPPC2P2-201ENST00000517589 409 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LINC00587B1AMM8 AC246817.1-201ENST00000520024 610 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
LINC00587B1AMM8 IGKV2-18-201ENST00000522607 343 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LINC00587B1AMM8 SOX5P1-201ENST00000524155 1127 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LINC00587B1AMM8 NAV2-AS3-201ENST00000534036 598 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
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