Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Speer3W4VSP1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms