Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2C6

Upk1b, Uroplakin-1b, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk1bQ9Z2C6 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upk1bQ9Z2C6 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upk1bQ9Z2C6 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upk1bQ9Z2C6 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upk1bQ9Z2C6 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upk1bQ9Z2C6 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upk1bQ9Z2C6 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upk1bQ9Z2C6 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upk1bQ9Z2C6 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upk1bQ9Z2C6 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upk1bQ9Z2C6 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Upk1bQ9Z2C6 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Upk1bQ9Z2C6 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upk1bQ9Z2C6 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upk1bQ9Z2C6 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upk1bQ9Z2C6 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upk1bQ9Z2C6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upk1bQ9Z2C6 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upk1bQ9Z2C6 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upk1bQ9Z2C6 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upk1bQ9Z2C6 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upk1bQ9Z2C6 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upk1bQ9Z2C6 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upk1bQ9Z2C6 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upk1bQ9Z2C6 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upk1bQ9Z2C6 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upk1bQ9Z2C6 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upk1bQ9Z2C6 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upk1bQ9Z2C6 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upk1bQ9Z2C6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upk1bQ9Z2C6 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upk1bQ9Z2C6 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upk1bQ9Z2C6 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upk1bQ9Z2C6 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upk1bQ9Z2C6 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upk1bQ9Z2C6 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upk1bQ9Z2C6 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upk1bQ9Z2C6 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Upk1bQ9Z2C6 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Upk1bQ9Z2C6 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upk1bQ9Z2C6 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upk1bQ9Z2C6 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upk1bQ9Z2C6 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upk1bQ9Z2C6 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upk1bQ9Z2C6 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upk1bQ9Z2C6 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk1bQ9Z2C6 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk1bQ9Z2C6 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk1bQ9Z2C6 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk1bQ9Z2C6 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk1bQ9Z2C6 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk1bQ9Z2C6 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk1bQ9Z2C6 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk1bQ9Z2C6 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk1bQ9Z2C6 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk1bQ9Z2C6 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk1bQ9Z2C6 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk1bQ9Z2C6 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk1bQ9Z2C6 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk1bQ9Z2C6 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk1bQ9Z2C6 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk1bQ9Z2C6 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk1bQ9Z2C6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk1bQ9Z2C6 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk1bQ9Z2C6 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk1bQ9Z2C6 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk1bQ9Z2C6 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk1bQ9Z2C6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk1bQ9Z2C6 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk1bQ9Z2C6 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upk1bQ9Z2C6 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upk1bQ9Z2C6 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upk1bQ9Z2C6 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upk1bQ9Z2C6 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upk1bQ9Z2C6 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upk1bQ9Z2C6 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upk1bQ9Z2C6 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upk1bQ9Z2C6 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upk1bQ9Z2C6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upk1bQ9Z2C6 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upk1bQ9Z2C6 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upk1bQ9Z2C6 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upk1bQ9Z2C6 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upk1bQ9Z2C6 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upk1bQ9Z2C6 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upk1bQ9Z2C6 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upk1bQ9Z2C6 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Upk1bQ9Z2C6 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms