Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q9

Vars, Valine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VarsQ9Z1Q9 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms