Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx1Q9WV80 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx1Q9WV80 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx1Q9WV80 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx1Q9WV80 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx1Q9WV80 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx1Q9WV80 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx1Q9WV80 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx1Q9WV80 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx1Q9WV80 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx1Q9WV80 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx1Q9WV80 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx1Q9WV80 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx1Q9WV80 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx1Q9WV80 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx1Q9WV80 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx1Q9WV80 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx1Q9WV80 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx1Q9WV80 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx1Q9WV80 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx1Q9WV80 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx1Q9WV80 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx1Q9WV80 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx1Q9WV80 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx1Q9WV80 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx1Q9WV80 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx1Q9WV80 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx1Q9WV80 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx1Q9WV80 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx1Q9WV80 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx1Q9WV80 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx1Q9WV80 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx1Q9WV80 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx1Q9WV80 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx1Q9WV80 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx1Q9WV80 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx1Q9WV80 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx1Q9WV80 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx1Q9WV80 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx1Q9WV80 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx1Q9WV80 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx1Q9WV80 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms