Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR5

Cdh13, Cadherin-13, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh13Q9WTR5 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms