Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A3

Ntn3, Netrin-3, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntn3Q9R1A3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ntn3Q9R1A3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ntn3Q9R1A3 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ntn3Q9R1A3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ntn3Q9R1A3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ntn3Q9R1A3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ntn3Q9R1A3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ntn3Q9R1A3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ntn3Q9R1A3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ntn3Q9R1A3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ntn3Q9R1A3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ntn3Q9R1A3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ntn3Q9R1A3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ntn3Q9R1A3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ntn3Q9R1A3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ntn3Q9R1A3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ntn3Q9R1A3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ntn3Q9R1A3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ntn3Q9R1A3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ntn3Q9R1A3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ntn3Q9R1A3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ntn3Q9R1A3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ntn3Q9R1A3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ntn3Q9R1A3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ntn3Q9R1A3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ntn3Q9R1A3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ntn3Q9R1A3 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ntn3Q9R1A3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ntn3Q9R1A3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ntn3Q9R1A3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ntn3Q9R1A3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ntn3Q9R1A3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ntn3Q9R1A3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ntn3Q9R1A3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ntn3Q9R1A3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ntn3Q9R1A3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ntn3Q9R1A3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ntn3Q9R1A3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ntn3Q9R1A3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ntn3Q9R1A3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ntn3Q9R1A3 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ntn3Q9R1A3 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ntn3Q9R1A3 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ntn3Q9R1A3 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ntn3Q9R1A3 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ntn3Q9R1A3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ntn3Q9R1A3 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ntn3Q9R1A3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ntn3Q9R1A3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ntn3Q9R1A3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ntn3Q9R1A3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ntn3Q9R1A3 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ntn3Q9R1A3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ntn3Q9R1A3 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ntn3Q9R1A3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ntn3Q9R1A3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ntn3Q9R1A3 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ntn3Q9R1A3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ntn3Q9R1A3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ntn3Q9R1A3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ntn3Q9R1A3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ntn3Q9R1A3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ntn3Q9R1A3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ntn3Q9R1A3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ntn3Q9R1A3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ntn3Q9R1A3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ntn3Q9R1A3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Ntn3Q9R1A3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ntn3Q9R1A3 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ntn3Q9R1A3 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ntn3Q9R1A3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ntn3Q9R1A3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ntn3Q9R1A3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ntn3Q9R1A3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ntn3Q9R1A3 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ntn3Q9R1A3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ntn3Q9R1A3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ntn3Q9R1A3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ntn3Q9R1A3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ntn3Q9R1A3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ntn3Q9R1A3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ntn3Q9R1A3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ntn3Q9R1A3 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ntn3Q9R1A3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ntn3Q9R1A3 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ntn3Q9R1A3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ntn3Q9R1A3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ntn3Q9R1A3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ntn3Q9R1A3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ntn3Q9R1A3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ntn3Q9R1A3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ntn3Q9R1A3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ntn3Q9R1A3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ntn3Q9R1A3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ntn3Q9R1A3 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ntn3Q9R1A3 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ntn3Q9R1A3 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ntn3Q9R1A3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ntn3Q9R1A3 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms