Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS8

Sh2d3c, SH2 domain-containing protein 3C, mousemouse

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d3cQ9QZS8 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sh2d3cQ9QZS8 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Sh2d3cQ9QZS8 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sh2d3cQ9QZS8 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh2d3cQ9QZS8 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh2d3cQ9QZS8 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh2d3cQ9QZS8 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh2d3cQ9QZS8 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh2d3cQ9QZS8 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh2d3cQ9QZS8 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh2d3cQ9QZS8 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh2d3cQ9QZS8 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh2d3cQ9QZS8 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh2d3cQ9QZS8 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh2d3cQ9QZS8 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh2d3cQ9QZS8 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh2d3cQ9QZS8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh2d3cQ9QZS8 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh2d3cQ9QZS8 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh2d3cQ9QZS8 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh2d3cQ9QZS8 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh2d3cQ9QZS8 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh2d3cQ9QZS8 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh2d3cQ9QZS8 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh2d3cQ9QZS8 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh2d3cQ9QZS8 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh2d3cQ9QZS8 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh2d3cQ9QZS8 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh2d3cQ9QZS8 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh2d3cQ9QZS8 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh2d3cQ9QZS8 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh2d3cQ9QZS8 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh2d3cQ9QZS8 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh2d3cQ9QZS8 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh2d3cQ9QZS8 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh2d3cQ9QZS8 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh2d3cQ9QZS8 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh2d3cQ9QZS8 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh2d3cQ9QZS8 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh2d3cQ9QZS8 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh2d3cQ9QZS8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh2d3cQ9QZS8 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh2d3cQ9QZS8 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh2d3cQ9QZS8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh2d3cQ9QZS8 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh2d3cQ9QZS8 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh2d3cQ9QZS8 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh2d3cQ9QZS8 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh2d3cQ9QZS8 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh2d3cQ9QZS8 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh2d3cQ9QZS8 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh2d3cQ9QZS8 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh2d3cQ9QZS8 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh2d3cQ9QZS8 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh2d3cQ9QZS8 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh2d3cQ9QZS8 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh2d3cQ9QZS8 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh2d3cQ9QZS8 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh2d3cQ9QZS8 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh2d3cQ9QZS8 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh2d3cQ9QZS8 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh2d3cQ9QZS8 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh2d3cQ9QZS8 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh2d3cQ9QZS8 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh2d3cQ9QZS8 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh2d3cQ9QZS8 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh2d3cQ9QZS8 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh2d3cQ9QZS8 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh2d3cQ9QZS8 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh2d3cQ9QZS8 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh2d3cQ9QZS8 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh2d3cQ9QZS8 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh2d3cQ9QZS8 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh2d3cQ9QZS8 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh2d3cQ9QZS8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh2d3cQ9QZS8 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh2d3cQ9QZS8 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh2d3cQ9QZS8 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh2d3cQ9QZS8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh2d3cQ9QZS8 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh2d3cQ9QZS8 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh2d3cQ9QZS8 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh2d3cQ9QZS8 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh2d3cQ9QZS8 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh2d3cQ9QZS8 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh2d3cQ9QZS8 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh2d3cQ9QZS8 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh2d3cQ9QZS8 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh2d3cQ9QZS8 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh2d3cQ9QZS8 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh2d3cQ9QZS8 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms