Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnnt3Q9QZ47 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnnt3Q9QZ47 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnnt3Q9QZ47 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnnt3Q9QZ47 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnnt3Q9QZ47 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnnt3Q9QZ47 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnnt3Q9QZ47 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnnt3Q9QZ47 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnnt3Q9QZ47 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnnt3Q9QZ47 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnnt3Q9QZ47 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnnt3Q9QZ47 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnnt3Q9QZ47 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnnt3Q9QZ47 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnnt3Q9QZ47 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnnt3Q9QZ47 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnnt3Q9QZ47 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnnt3Q9QZ47 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnnt3Q9QZ47 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnnt3Q9QZ47 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnnt3Q9QZ47 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnnt3Q9QZ47 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnnt3Q9QZ47 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnnt3Q9QZ47 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnnt3Q9QZ47 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnnt3Q9QZ47 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnnt3Q9QZ47 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnnt3Q9QZ47 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnnt3Q9QZ47 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnnt3Q9QZ47 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnnt3Q9QZ47 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnnt3Q9QZ47 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnnt3Q9QZ47 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnnt3Q9QZ47 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnnt3Q9QZ47 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnnt3Q9QZ47 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnnt3Q9QZ47 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnnt3Q9QZ47 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnnt3Q9QZ47 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnnt3Q9QZ47 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnnt3Q9QZ47 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnnt3Q9QZ47 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnnt3Q9QZ47 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnnt3Q9QZ47 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnnt3Q9QZ47 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnnt3Q9QZ47 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnnt3Q9QZ47 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnnt3Q9QZ47 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnnt3Q9QZ47 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnnt3Q9QZ47 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnnt3Q9QZ47 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnnt3Q9QZ47 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnnt3Q9QZ47 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnnt3Q9QZ47 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnnt3Q9QZ47 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnnt3Q9QZ47 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnnt3Q9QZ47 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnnt3Q9QZ47 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnnt3Q9QZ47 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnnt3Q9QZ47 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnnt3Q9QZ47 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnnt3Q9QZ47 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnnt3Q9QZ47 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnnt3Q9QZ47 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnnt3Q9QZ47 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnnt3Q9QZ47 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnnt3Q9QZ47 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnnt3Q9QZ47 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnnt3Q9QZ47 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnnt3Q9QZ47 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnnt3Q9QZ47 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tnnt3Q9QZ47 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tnnt3Q9QZ47 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tnnt3Q9QZ47 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnnt3Q9QZ47 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnnt3Q9QZ47 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnnt3Q9QZ47 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnnt3Q9QZ47 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnnt3Q9QZ47 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnnt3Q9QZ47 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnnt3Q9QZ47 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnnt3Q9QZ47 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnnt3Q9QZ47 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnnt3Q9QZ47 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnnt3Q9QZ47 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnnt3Q9QZ47 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnnt3Q9QZ47 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnnt3Q9QZ47 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnnt3Q9QZ47 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnnt3Q9QZ47 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnnt3Q9QZ47 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnnt3Q9QZ47 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnnt3Q9QZ47 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnnt3Q9QZ47 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnnt3Q9QZ47 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnnt3Q9QZ47 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnnt3Q9QZ47 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnnt3Q9QZ47 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnnt3Q9QZ47 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.1 ms