Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX11

Cyth1, Cytohesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyth1Q9QX11 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyth1Q9QX11 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyth1Q9QX11 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyth1Q9QX11 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyth1Q9QX11 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyth1Q9QX11 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyth1Q9QX11 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyth1Q9QX11 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyth1Q9QX11 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyth1Q9QX11 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyth1Q9QX11 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyth1Q9QX11 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyth1Q9QX11 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyth1Q9QX11 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyth1Q9QX11 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyth1Q9QX11 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyth1Q9QX11 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyth1Q9QX11 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cyth1Q9QX11 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cyth1Q9QX11 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cyth1Q9QX11 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cyth1Q9QX11 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cyth1Q9QX11 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cyth1Q9QX11 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cyth1Q9QX11 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms